More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0858 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  91.81 
 
 		 452 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  87.53 
 
 		 457 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  100 
 
 		 452 aa  895    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  92.2 
 
 		 452 aa  820    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  86.07 
 
 		 459 aa  761    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  81.55 
 
 		 464 aa  718    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  92.2 
 
 		 452 aa  820    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  85.33 
 
 		 457 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  83.82 
 
 		 456 aa  740    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  92.2 
 
 		 452 aa  820    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  94.69 
 
 		 452 aa  846    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  90.93 
 
 		 452 aa  818    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  94.47 
 
 		 452 aa  845    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  95.35 
 
 		 452 aa  852    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  64.29 
 
 		 460 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  62.58 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  63.57 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  62.67 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  61.89 
 
 		 458 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  59.37 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  59.14 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  63.12 
 
 		 456 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  62.98 
 
 		 468 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  57.37 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  62.32 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  61.54 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  56.66 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  60.45 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  53.78 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  53.55 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  53.55 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  53.78 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  53.55 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  53.55 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  53.55 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  53.55 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  53.55 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  53.32 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  51.47 
 
 		 457 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  54.77 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  51.02 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  54.67 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  51.8 
 
 		 457 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  52.27 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  50.9 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  52.03 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  51.8 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  51.23 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  51.45 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  51.79 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  50.68 
 
 		 458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  50.68 
 
 		 458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  50.68 
 
 		 458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  50.68 
 
 		 458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  50.79 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  53.08 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  48.65 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  49.13 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  50.8 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  49.46 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  47.73 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  49.77 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  51.78 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  47.61 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  49.78 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  49.57 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  50.11 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  49.21 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  50 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  47.98 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  49.89 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  47.03 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  48.28 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  49.2 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  53.7 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  49.89 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  49.55 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  51.24 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  45.8 
 
 		 458 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  49.88 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  48.31 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  45.51 
 
 		 471 aa  356  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  45.23 
 
 		 460 aa  352  8.999999999999999e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  47.62 
 
 		 447 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  47.64 
 
 		 454 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  47.76 
 
 		 467 aa  348  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  42.34 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  45.13 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  45.91 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  50.22 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  42.86 
 
 		 479 aa  339  7e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  46.17 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  46.7 
 
 		 450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  41.18 
 
 		 456 aa  336  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  51.9 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  47.67 
 
 		 490 aa  333  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  42.73 
 
 		 457 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  42.54 
 
 		 472 aa  330  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  44.85 
 
 		 469 aa  325  8.000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  45.83 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>