More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0495 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  100 
 
 		 504 aa  1015    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  58.08 
 
 		 524 aa  596  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  60.17 
 
 		 502 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  58.97 
 
 		 493 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  51.92 
 
 		 553 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  52.81 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  53.12 
 
 		 518 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  50.39 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  48.91 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  50.83 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  47.24 
 
 		 523 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  43.7 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  45.87 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  46 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  43.91 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  48.33 
 
 		 498 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  46.73 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  47.17 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  46.73 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  41.65 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  44.82 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41 
 
 		 455 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  41 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 		 455 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  40.77 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 		 455 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  40.77 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  41.06 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  40.55 
 
 		 455 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  40.55 
 
 		 455 aa  296  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  40.77 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  37.08 
 
 		 488 aa  293  4e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  39.82 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  37.36 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  41.09 
 
 		 459 aa  289  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  36.73 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  49.09 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  43.72 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  39.82 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  41.53 
 
 		 448 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  39.64 
 
 		 462 aa  279  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  38.41 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  38.97 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  39.69 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  39.6 
 
 		 459 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  40.72 
 
 		 456 aa  276  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  39.19 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  39.42 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  39.86 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  39.2 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  48.19 
 
 		 575 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  38.46 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  38.73 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  38.43 
 
 		 458 aa  269  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  38.43 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  38.43 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  38.19 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  38.8 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  38.66 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  38.19 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  37.64 
 
 		 457 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  40.15 
 
 		 464 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  38.57 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  34.69 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  39.81 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  35.9 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  38.17 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  38.17 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  38.17 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  38.17 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  37.47 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  40.84 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  36.17 
 
 		 449 aa  263  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  39.47 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  37.08 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  40.93 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  36.72 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  39.51 
 
 		 443 aa  261  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  37.75 
 
 		 452 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  41.09 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  37.47 
 
 		 463 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  37.72 
 
 		 452 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  37.27 
 
 		 459 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  38.13 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  37.53 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  37.5 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  38.83 
 
 		 445 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  37.53 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  36.63 
 
 		 459 aa  257  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  36.69 
 
 		 460 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  39.05 
 
 		 448 aa  256  8e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  39.05 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  37.86 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  36.05 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.62 
 
 		 543 aa  252  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  40.45 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  37.36 
 
 		 447 aa  252  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  39.31 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  38.48 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>