More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0222 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  100 
 
 
481 aa  944    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  56 
 
 
502 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  49.48 
 
 
524 aa  464  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  49.04 
 
 
499 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  45.87 
 
 
504 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  44.61 
 
 
553 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  47.36 
 
 
512 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  46.62 
 
 
518 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.47 
 
 
542 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  44.7 
 
 
470 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  46.4 
 
 
472 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  44.28 
 
 
470 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  46.04 
 
 
493 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  44.82 
 
 
498 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.31 
 
 
509 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  42.04 
 
 
523 aa  355  7.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  38.77 
 
 
488 aa  340  2e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  39.12 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  40.86 
 
 
513 aa  329  8e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  42.32 
 
 
458 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  35.16 
 
 
467 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  41.72 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  35.96 
 
 
460 aa  286  4e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  41.22 
 
 
448 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  39.08 
 
 
456 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  34.39 
 
 
460 aa  276  5e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  38.27 
 
 
464 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  38.15 
 
 
458 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  37.58 
 
 
460 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  37.28 
 
 
455 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  45.64 
 
 
575 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  37.5 
 
 
455 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  37.06 
 
 
455 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  37.06 
 
 
455 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.06 
 
 
455 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  37.06 
 
 
455 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  37.06 
 
 
455 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  37.06 
 
 
455 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  37.83 
 
 
443 aa  269  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  34.62 
 
 
447 aa  268  1e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.06 
 
 
455 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  38.95 
 
 
471 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  36.84 
 
 
455 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  38.98 
 
 
462 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  36.05 
 
 
463 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  37.03 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  38.35 
 
 
435 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  37.61 
 
 
462 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  36.8 
 
 
445 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  37.66 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  41.33 
 
 
454 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  35.7 
 
 
456 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  34.81 
 
 
455 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  37.24 
 
 
453 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  37.42 
 
 
452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  37.42 
 
 
452 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  38.83 
 
 
459 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  37.04 
 
 
457 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  34.45 
 
 
433 aa  259  9e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  35.94 
 
 
453 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  32.77 
 
 
454 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  36.42 
 
 
452 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  37.42 
 
 
445 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  38 
 
 
448 aa  256  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  37.15 
 
 
452 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  35.25 
 
 
460 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  37.34 
 
 
441 aa  256  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  33.62 
 
 
477 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  37.61 
 
 
452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  37.2 
 
 
452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  37.81 
 
 
464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  36.78 
 
 
452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  36.78 
 
 
452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  36.78 
 
 
452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  37.58 
 
 
456 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  37.61 
 
 
456 aa  253  7e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  38.1 
 
 
453 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  38.42 
 
 
470 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  46.77 
 
 
553 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  35.52 
 
 
458 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  38.65 
 
 
446 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  34.33 
 
 
458 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  33.83 
 
 
457 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  38.49 
 
 
457 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  35.21 
 
 
456 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  36.28 
 
 
458 aa  250  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  35.31 
 
 
458 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  35.31 
 
 
458 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  35.1 
 
 
458 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  35.1 
 
 
458 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  35.95 
 
 
505 aa  249  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  37.23 
 
 
424 aa  249  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  36.66 
 
 
460 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  35.01 
 
 
457 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  34.95 
 
 
459 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  35.16 
 
 
458 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  33.83 
 
 
459 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  39.04 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  35.43 
 
 
459 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>