More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4786 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  100 
 
 		 472 aa  937    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  58.74 
 
 		 499 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  51.06 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  51.82 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  51.39 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  50.85 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  49.24 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  48.59 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  46.4 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  49.35 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  47.17 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  47.23 
 
 		 518 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  44.63 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  43.92 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.47 
 
 		 542 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.65 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  40.6 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  42.34 
 
 		 523 aa  334  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  44.52 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  40.86 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  38.69 
 
 		 513 aa  316  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  38.94 
 
 		 467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  37.81 
 
 		 454 aa  299  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  38.3 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  38.82 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  43.24 
 
 		 471 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  39.9 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  37.99 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  41.4 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  46.95 
 
 		 575 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  39.5 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  38.28 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  37.05 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  38.76 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  37.47 
 
 		 447 aa  279  8e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  38.09 
 
 		 459 aa  279  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  39.54 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  38.19 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  44.48 
 
 		 553 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  38.48 
 
 		 455 aa  277  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  37.81 
 
 		 455 aa  276  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  40.09 
 
 		 435 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  37.26 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  39.75 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  37.55 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  37.81 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  37.81 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  37.77 
 
 		 455 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  39.46 
 
 		 445 aa  273  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.81 
 
 		 455 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.06 
 
 		 543 aa  272  9e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  39.37 
 
 		 449 aa  272  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.58 
 
 		 455 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  37.58 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  37.58 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  37.55 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  37.98 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  37.11 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  37.11 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  37.11 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  37.58 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  37.08 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  37.04 
 
 		 452 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  37.03 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  37.34 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  37.34 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  37.31 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  40.88 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  40.64 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  38.23 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  37.39 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  36.92 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  37.1 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  39.13 
 
 		 424 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  36.21 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  36.4 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  39.86 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  38.06 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  42.05 
 
 		 459 aa  260  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  36.63 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  39.32 
 
 		 459 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  40.79 
 
 		 458 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  40.79 
 
 		 458 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  40.79 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  40.79 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  40.44 
 
 		 459 aa  259  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  38.34 
 
 		 457 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  37.95 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  40.73 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  36.47 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  39.19 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  37.86 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  38.64 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  38.05 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  39.95 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  36.64 
 
 		 460 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  36.11 
 
 		 483 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  35.88 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  36.79 
 
 		 476 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  40.31 
 
 		 454 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>