More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  100 
 
 		 558 aa  1103    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  54.44 
 
 		 513 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  51.35 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  43.91 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  45.19 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  44.76 
 
 		 553 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  44.07 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  44.72 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  43.5 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  43.21 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  42.42 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  43.4 
 
 		 542 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  44.05 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  39.12 
 
 		 481 aa  348  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  40.6 
 
 		 472 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  41.11 
 
 		 470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  41.11 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  40.74 
 
 		 523 aa  330  6e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  42.42 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  40.21 
 
 		 498 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  43.71 
 
 		 458 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  35.96 
 
 		 488 aa  286  5.999999999999999e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  40.59 
 
 		 459 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  42.99 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  42.18 
 
 		 471 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  35.17 
 
 		 447 aa  267  4e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  39.87 
 
 		 460 aa  267  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  37.07 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  38.67 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  39.29 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  39.03 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  37.75 
 
 		 458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  35.01 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  39.54 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  39.54 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  39.31 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  39.31 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  39.41 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  38 
 
 		 456 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  39.41 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  31.88 
 
 		 460 aa  257  5e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  39.34 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  39.27 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  38.33 
 
 		 459 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  39.91 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  42.27 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  39.95 
 
 		 448 aa  249  8e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  39.25 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  36.84 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  37.59 
 
 		 443 aa  248  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  38.41 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  36.71 
 
 		 460 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  31.17 
 
 		 460 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  35.68 
 
 		 433 aa  246  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  36.43 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  35.39 
 
 		 477 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  36.4 
 
 		 455 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  36.62 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  38.19 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  38.74 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  36.84 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  38.43 
 
 		 453 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  38.37 
 
 		 435 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.39 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  36.94 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  36.29 
 
 		 456 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.84 
 
 		 455 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  36.84 
 
 		 455 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  36.84 
 
 		 455 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  39.85 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  36.84 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  37.31 
 
 		 456 aa  241  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  37.12 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  41.22 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  38.76 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  39.39 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  38.91 
 
 		 459 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  39.21 
 
 		 454 aa  236  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  37.56 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  39.06 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  35.84 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  40.06 
 
 		 543 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  37.03 
 
 		 470 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  37.29 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  35.76 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  34.7 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  37.75 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  37.08 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  38.86 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  34.7 
 
 		 462 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  36.38 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  36.77 
 
 		 450 aa  226  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  40.57 
 
 		 472 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  35.62 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  31.17 
 
 		 483 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  36.02 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  32.28 
 
 		 479 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  32.28 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  41.9 
 
 		 575 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  39.62 
 
 		 452 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>