More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4787 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  100 
 
 		 499 aa  998    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  58.74 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  51.92 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  50.58 
 
 		 502 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  52.72 
 
 		 524 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  54.89 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  54.47 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  55.86 
 
 		 498 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  51.98 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  49.32 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  50.41 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  50.41 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  49.04 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  51.66 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  48.76 
 
 		 542 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  47.91 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  43.34 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  44.05 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  45.75 
 
 		 458 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  40.69 
 
 		 467 aa  335  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  41.29 
 
 		 488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  42.09 
 
 		 513 aa  322  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  44.59 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  43.65 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  42.16 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  46.72 
 
 		 553 aa  299  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  39.46 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  41.06 
 
 		 453 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  41.06 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  41.98 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  41.65 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  39.68 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  47.93 
 
 		 575 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  38.62 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  36.89 
 
 		 454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  41.37 
 
 		 449 aa  290  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  40.35 
 
 		 455 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  38.39 
 
 		 455 aa  289  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  37.99 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  37.95 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  38.17 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  38.39 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  38.17 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  39.39 
 
 		 452 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  42.39 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  39.39 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  39.39 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  39.39 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  38.17 
 
 		 455 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  39.4 
 
 		 457 aa  286  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  38.17 
 
 		 455 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  38.17 
 
 		 455 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  37.95 
 
 		 455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  39.06 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  39 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  39.05 
 
 		 452 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  40.97 
 
 		 460 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  39.55 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  37.53 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  40 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  39.05 
 
 		 452 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  39.05 
 
 		 452 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  40.62 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  40 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  38.46 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  39.32 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  39.91 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  39.32 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  39.1 
 
 		 458 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  39.1 
 
 		 458 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  39.14 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  39.05 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  40.77 
 
 		 424 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  38.3 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  40.05 
 
 		 467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  39.87 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  34.79 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  37.8 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  38.03 
 
 		 456 aa  272  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  37.47 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  40.05 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  38.67 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  35.56 
 
 		 460 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  38.08 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  38.68 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  38.99 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  36.92 
 
 		 477 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  41.99 
 
 		 446 aa  269  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  41.78 
 
 		 454 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  37.35 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  36.63 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  37.82 
 
 		 459 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  37.42 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  36.2 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  40 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  36.04 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  42.6 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  38.79 
 
 		 443 aa  264  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  37.17 
 
 		 460 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  38.67 
 
 		 464 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>