More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04350 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  100 
 
 		 513 aa  1013    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  54.44 
 
 		 558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  48.86 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  46 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  47.31 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  49.39 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  48.12 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  46.2 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  44.58 
 
 		 518 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  43.31 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  43.36 
 
 		 542 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  41.75 
 
 		 523 aa  368  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  41.06 
 
 		 502 aa  350  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  40.86 
 
 		 481 aa  348  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  42.09 
 
 		 499 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  38.06 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  41.32 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  38.69 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  41.15 
 
 		 470 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  41.15 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  42.96 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  43.63 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  42.89 
 
 		 459 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  42.47 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  35.36 
 
 		 488 aa  264  4e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  35.7 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  43.43 
 
 		 553 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  34.96 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  40.29 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  38.35 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  40.86 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  37.15 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  36.82 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  38 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  36.57 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  35.71 
 
 		 460 aa  253  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  33.48 
 
 		 460 aa  253  8.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  36.34 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  36.41 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  38.9 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  36.57 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  40.39 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  36.18 
 
 		 455 aa  250  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.18 
 
 		 455 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  40 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  38.41 
 
 		 457 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  36.18 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  36.18 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  37.18 
 
 		 433 aa  248  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  36.18 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  35.94 
 
 		 455 aa  247  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  41.36 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  36.77 
 
 		 458 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  40.52 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  39.35 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  36.2 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  34.08 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  40.99 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  39.04 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  38.48 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  35.99 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  36.04 
 
 		 453 aa  238  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  38.11 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  35.37 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  34.09 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  38.2 
 
 		 458 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  39.33 
 
 		 461 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  34.09 
 
 		 462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  38.2 
 
 		 458 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  38.2 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  38.2 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  39.43 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  38.08 
 
 		 458 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  40.92 
 
 		 443 aa  236  9e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  38.54 
 
 		 459 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  35.81 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  35.87 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  40.16 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  36.98 
 
 		 443 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  35.15 
 
 		 458 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  35.53 
 
 		 456 aa  233  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  35.15 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  38.61 
 
 		 447 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  34.57 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  36.15 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  40 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  35.7 
 
 		 476 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  35.93 
 
 		 456 aa  230  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  41.04 
 
 		 472 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  39.13 
 
 		 450 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  33.03 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  34.16 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  37.65 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  43.47 
 
 		 575 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  35.32 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  35.81 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  35.9 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  38.27 
 
 		 490 aa  226  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  38.92 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  36.97 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>