More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1649 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  100 
 
 		 575 aa  1158    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  52.24 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.28 
 
 		 543 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1642  amino acid carrier protein  44.86 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856431  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  52.31 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  48.49 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  51.71 
 
 		 456 aa  296  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.44 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  44.44 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  44.44 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  47.8 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  44.44 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  47.8 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  47.65 
 
 		 457 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  47.8 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  44.16 
 
 		 455 aa  294  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  47.8 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.44 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  44.44 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  44.16 
 
 		 455 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  44.16 
 
 		 455 aa  292  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  44.16 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  47.21 
 
 		 458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  47.94 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  50.62 
 
 		 553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  46.45 
 
 		 453 aa  289  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  49.09 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  49.7 
 
 		 455 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  47.51 
 
 		 457 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  48.43 
 
 		 448 aa  286  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  48.48 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  48.66 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  45.45 
 
 		 459 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  45.13 
 
 		 449 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  46.63 
 
 		 460 aa  280  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  47.58 
 
 		 424 aa  279  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  47.32 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  49.36 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  47.08 
 
 		 458 aa  278  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  47.62 
 
 		 464 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  44.87 
 
 		 459 aa  277  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  47.8 
 
 		 493 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  47.94 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  47.46 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  45.64 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  45.22 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  48.19 
 
 		 504 aa  270  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  47.9 
 
 		 502 aa  270  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  47.15 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  45.67 
 
 		 462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  44.87 
 
 		 459 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  45.24 
 
 		 463 aa  266  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  45.62 
 
 		 449 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.77 
 
 		 542 aa  266  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  45.99 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  44.51 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  46.13 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  45.48 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  47.93 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  44.82 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  46.43 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  45.37 
 
 		 462 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  46.05 
 
 		 459 aa  259  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  45.11 
 
 		 460 aa  259  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  47.45 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  48.5 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  47.08 
 
 		 461 aa  256  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  44.05 
 
 		 464 aa  256  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  45.45 
 
 		 443 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  45.12 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  45.54 
 
 		 470 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  44.26 
 
 		 448 aa  253  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  42.27 
 
 		 456 aa  253  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  44.18 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  44.18 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  43.37 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  44.18 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  44.18 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  44.14 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  43.54 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  43.57 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  48.69 
 
 		 467 aa  251  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  46.35 
 
 		 503 aa  251  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  43.67 
 
 		 447 aa  251  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  44.78 
 
 		 450 aa  251  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  44.14 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  44.14 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  45.1 
 
 		 476 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  47.68 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  42.63 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  40.56 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  43.45 
 
 		 460 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  41.3 
 
 		 441 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  45.75 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  43.57 
 
 		 498 aa  246  8e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  44.44 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  48.75 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  42.64 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  41.07 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  47.26 
 
 		 472 aa  243  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>