More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1642 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1642  amino acid carrier protein  100 
 
 		 557 aa  1122    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  79.96 
 
 		 543 aa  901    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  44.68 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  41.06 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  44.66 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  45.69 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  51.5 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  45.11 
 
 		 455 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  44.38 
 
 		 455 aa  296  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  44.66 
 
 		 455 aa  296  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.38 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.1 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  48.48 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  44.1 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  44.1 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  44.1 
 
 		 455 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  52.38 
 
 		 455 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  49.84 
 
 		 458 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  47.75 
 
 		 460 aa  280  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  47.27 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  46.34 
 
 		 460 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  45.37 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  48.86 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  46.48 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  49.09 
 
 		 457 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  47.47 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  48.18 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  49.84 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  42.82 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  46.79 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  46.95 
 
 		 471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  47.37 
 
 		 457 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  45.38 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  48.89 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  47.87 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  45.92 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  46.31 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  45.91 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  47.88 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  50.72 
 
 		 476 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  45.78 
 
 		 502 aa  266  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  46.3 
 
 		 443 aa  266  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  51.82 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  47.5 
 
 		 493 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  46.06 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  46.06 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  46.06 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  45.65 
 
 		 458 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  46.06 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  46.36 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  44.13 
 
 		 512 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  46.06 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  46.06 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  46.06 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  47.5 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  46.06 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  45.62 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  46.92 
 
 		 456 aa  260  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  45.72 
 
 		 518 aa  259  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  45.77 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  45.19 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  45.77 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  47.11 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  47.01 
 
 		 453 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  45.45 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  45.19 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  46.04 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  44.9 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  44.9 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  48.7 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  45.15 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  45.77 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  44.17 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  47.83 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  42.2 
 
 		 457 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  47.6 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  46.94 
 
 		 459 aa  253  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  47.62 
 
 		 424 aa  252  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  45.77 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  45.11 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  46.9 
 
 		 459 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  43.6 
 
 		 463 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  32.54 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  43.96 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  43.51 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  44.11 
 
 		 499 aa  248  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  41.78 
 
 		 503 aa  247  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  43.03 
 
 		 476 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  45.73 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  43.53 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.06 
 
 		 542 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  32.54 
 
 		 487 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  46.13 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  43.37 
 
 		 498 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  46.13 
 
 		 448 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  32.18 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  32.18 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  32.18 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  31.81 
 
 		 487 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  32.18 
 
 		 486 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>