More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3308 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  94.47 
 
 
452 aa  845    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  91.98 
 
 
452 aa  819    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  82.12 
 
 
456 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  85.33 
 
 
457 aa  738    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  91.98 
 
 
452 aa  819    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  98.01 
 
 
452 aa  881    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  87.3 
 
 
457 aa  776    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  91.59 
 
 
452 aa  824    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  80.64 
 
 
464 aa  714    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  99.78 
 
 
452 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  100 
 
 
452 aa  896    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  91.81 
 
 
452 aa  824    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  85.11 
 
 
459 aa  763    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  91.98 
 
 
452 aa  819    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  63.11 
 
 
460 aa  565  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  62.9 
 
 
456 aa  547  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  62.11 
 
 
458 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  62.28 
 
 
463 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  62.11 
 
 
458 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  58.81 
 
 
462 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  58.59 
 
 
462 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  63.57 
 
 
456 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  63.21 
 
 
468 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  57.53 
 
 
448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  62.8 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  61.99 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  60.9 
 
 
458 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  56.66 
 
 
447 aa  464  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  53.21 
 
 
455 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  52.98 
 
 
455 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  52.98 
 
 
455 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  52.98 
 
 
455 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  53.21 
 
 
455 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  52.75 
 
 
455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  52.98 
 
 
455 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  52.98 
 
 
455 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  52.98 
 
 
455 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  52.98 
 
 
455 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  54.67 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  50.99 
 
 
456 aa  431  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  55.81 
 
 
445 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  52.24 
 
 
458 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  51.33 
 
 
457 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  52.7 
 
 
459 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  52.03 
 
 
459 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  51.8 
 
 
457 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  52.32 
 
 
455 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  51.01 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  51.89 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  51.01 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  51.01 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  51.01 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  51.89 
 
 
449 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  51.45 
 
 
464 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  50 
 
 
505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  51.24 
 
 
460 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  50.22 
 
 
460 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  52.85 
 
 
445 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  47.95 
 
 
441 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  50.68 
 
 
456 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  50.45 
 
 
453 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  50.45 
 
 
453 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  50.45 
 
 
453 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
449 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  52.26 
 
 
459 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  47.84 
 
 
443 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  50.24 
 
 
458 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  48.31 
 
 
443 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  48.93 
 
 
498 aa  385  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  48.35 
 
 
459 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  50 
 
 
447 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  49.35 
 
 
492 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  50.46 
 
 
443 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  51.88 
 
 
452 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  49.66 
 
 
448 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  51.05 
 
 
435 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  46.26 
 
 
458 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  49.23 
 
 
476 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  50.9 
 
 
461 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  50.58 
 
 
424 aa  366  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  48.31 
 
 
446 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  45.81 
 
 
471 aa  361  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  47.42 
 
 
454 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  45.06 
 
 
460 aa  352  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  44.59 
 
 
472 aa  351  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  48.22 
 
 
467 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  47.74 
 
 
447 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  41.81 
 
 
451 aa  349  6e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  46.15 
 
 
464 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  50.22 
 
 
487 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  47.07 
 
 
470 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  46.19 
 
 
450 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  44.05 
 
 
479 aa  341  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  51.9 
 
 
472 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  43.21 
 
 
457 aa  339  5e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  43.64 
 
 
472 aa  339  5e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  41.18 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  47.67 
 
 
490 aa  336  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  45.08 
 
 
469 aa  332  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  46.62 
 
 
456 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>