More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2852 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  100 
 
 		 463 aa  914    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  76.19 
 
 		 468 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  64.33 
 
 		 456 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  64.71 
 
 		 458 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  64.13 
 
 		 460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  64.27 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  63.18 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  63.4 
 
 		 462 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  62.5 
 
 		 452 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  62.28 
 
 		 452 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  62.28 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  62.67 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  61.95 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  61.86 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  61.86 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  60.65 
 
 		 457 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  61.86 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  61.78 
 
 		 459 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  63.1 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  61.83 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  62.44 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  60.87 
 
 		 457 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  60.44 
 
 		 456 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  63.45 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  57.34 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  61.64 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  62.03 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  55.8 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  55.53 
 
 		 455 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  55.23 
 
 		 445 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  54.33 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  50.11 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  50.11 
 
 		 455 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  50.11 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  50.11 
 
 		 455 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  50.11 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  49.89 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  49.67 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  50.11 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  49.67 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  49.23 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  53.06 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  52.28 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  52.06 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  52.06 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  52.06 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  51.52 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  52.06 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  52.95 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  52.52 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  51.97 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  52.95 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  50.54 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  51.22 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  52.16 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  50.62 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  51.66 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  51.08 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  50.76 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  52.28 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  52.37 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  51.44 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  51.45 
 
 		 448 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  51.65 
 
 		 454 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  51.13 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  52.05 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  50.31 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  51.01 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  50.76 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  47.25 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  51.79 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  46.14 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  49.21 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  51.24 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  51 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  50.1 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  50.22 
 
 		 459 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  48.9 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  50.99 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  49.77 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  48.85 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  47.56 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  51.95 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  45.05 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  48.05 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  51.36 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  49.67 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  47.01 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  48.97 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  50.54 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  45.81 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1002  amino acid carrier protein  44.81 
 
 		 482 aa  359  6e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.663557  normal  0.482987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  43.62 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  42.92 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  45.7 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  51.34 
 
 		 456 aa  356  5.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  44.69 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  44.33 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  48.83 
 
 		 487 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  47.7 
 
 		 472 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>