More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2725 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  100 
 
 		 502 aa  1002    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  56 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  51.92 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  49.38 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  50 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  49.18 
 
 		 553 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  48.88 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  51.06 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  50.1 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  43.7 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.4 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  46.91 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  46.04 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  43.71 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  42.75 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  43.5 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  43.37 
 
 		 523 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  43.21 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  44.44 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  40.42 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  41.06 
 
 		 513 aa  328  9e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  39.7 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  44.03 
 
 		 456 aa  317  5e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  43.36 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  39.78 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  39.04 
 
 		 460 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  38.79 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  36.64 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  38.44 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  39.61 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  39.04 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  41.49 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  40.29 
 
 		 459 aa  286  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  39.58 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  39 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  40.51 
 
 		 464 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  41.19 
 
 		 447 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  38 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  37.78 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  38 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  34.48 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  40.33 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  38 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  40.18 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  37.78 
 
 		 455 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  39.15 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  38.7 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  39.29 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  38.78 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  38.78 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  38 
 
 		 455 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.78 
 
 		 455 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  39.64 
 
 		 460 aa  279  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  37.56 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  37.56 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  39.12 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  39.06 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  39.06 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  39.06 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  40.6 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  32.98 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  38.67 
 
 		 449 aa  277  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  37.5 
 
 		 457 aa  276  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  37.09 
 
 		 456 aa  276  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  35.62 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  42.22 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  47.94 
 
 		 575 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  41.07 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  36.4 
 
 		 433 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  38.55 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  40.81 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  41.75 
 
 		 453 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  36.94 
 
 		 492 aa  272  9e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  38.26 
 
 		 459 aa  272  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  37.06 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  37.94 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  38.99 
 
 		 458 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  37.7 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  40.54 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  37.31 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  38.42 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  39.82 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  36.51 
 
 		 505 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  38 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  39.1 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  41.56 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  36.61 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  36.61 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  36.4 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  36.4 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  37.3 
 
 		 460 aa  267  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  38.22 
 
 		 455 aa  266  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  38.75 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  37.5 
 
 		 462 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  38.99 
 
 		 468 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  40.05 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  38.89 
 
 		 460 aa  263  6e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  37.14 
 
 		 458 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  38.67 
 
 		 443 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  37.28 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>