More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09140 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  100 
 
 		 523 aa  1051    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  47.06 
 
 		 553 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  48.61 
 
 		 502 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  47.42 
 
 		 524 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  48.88 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  48.08 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  47.24 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  49.2 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.26 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  43.37 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  46.18 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  42.04 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  43.34 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  41.75 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  40.74 
 
 		 558 aa  346  6e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  41.85 
 
 		 498 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  41.44 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  42.23 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  42.54 
 
 		 472 aa  323  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  37.14 
 
 		 467 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  41.02 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  38.28 
 
 		 477 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  47.84 
 
 		 553 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  34.49 
 
 		 488 aa  271  1e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  36.96 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  37.21 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  47.11 
 
 		 575 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.79 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  37.5 
 
 		 445 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  37.64 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  36.79 
 
 		 455 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  36.79 
 
 		 455 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.79 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  36.3 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  36.58 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  37.42 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  36.58 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  37.42 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  36.09 
 
 		 453 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  40.38 
 
 		 471 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  38.79 
 
 		 457 aa  249  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  39.76 
 
 		 458 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  38.94 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  36.44 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  36.15 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  36.46 
 
 		 435 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  38.1 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  36.23 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  38.1 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  36.54 
 
 		 458 aa  246  8e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  36.44 
 
 		 462 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  37.86 
 
 		 458 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  37.86 
 
 		 458 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  38.82 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  34.88 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  40.3 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  36.54 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  36.74 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  35.9 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  37.26 
 
 		 459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  30.6 
 
 		 460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  39.42 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  35.37 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  35.31 
 
 		 483 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  35.1 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  35.96 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  36.09 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  37.19 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  34.55 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  35.84 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  35.09 
 
 		 483 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  35.78 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  36.5 
 
 		 475 aa  236  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  36.72 
 
 		 460 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  36.32 
 
 		 424 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  40.65 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  35.49 
 
 		 458 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  34.92 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  37.27 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  38.39 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  36.25 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  37.47 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  36.46 
 
 		 445 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  33.41 
 
 		 447 aa  231  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  34.69 
 
 		 458 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  35.41 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  36.88 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  37.95 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  30.98 
 
 		 460 aa  229  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  34.9 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  33.04 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  35.12 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  37.85 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  35.33 
 
 		 452 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  37.47 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  33.67 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  35.12 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  38.33 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  34.85 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  34.85 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>