More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17880 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  77.04 
 
 		 505 aa  718    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  78.21 
 
 		 498 aa  747    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  100 
 
 		 492 aa  981    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  52.92 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  52.71 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  51.5 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  50.21 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  48.81 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  50.31 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  50 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  49.68 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  48.74 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  49.38 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  50 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  50 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  49.79 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  48.92 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  48.72 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  48.84 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  48.73 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  49.25 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  48.73 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  47.81 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  48.73 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  47.96 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  46.54 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  48.02 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  47.58 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  46.12 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  45.91 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  47.57 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  50.31 
 
 		 468 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  45.91 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  45.91 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  50.54 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.7 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  46.12 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  45.91 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  45.7 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  45.91 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  47.63 
 
 		 464 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  46.41 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  47.22 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  46.41 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  46.84 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  46.41 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  46.41 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  45.96 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  48.6 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  46.91 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  50.68 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  47.21 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  45.92 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  45.03 
 
 		 459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  46.09 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  45.38 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  49.89 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  44.69 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  45.67 
 
 		 459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  46.09 
 
 		 452 aa  356  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  46.32 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  45.38 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  46.28 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  46.24 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  46.37 
 
 		 453 aa  350  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  50.11 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  42.23 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  47.97 
 
 		 461 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  45.77 
 
 		 467 aa  335  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  45.63 
 
 		 459 aa  333  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  44.42 
 
 		 447 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  45.08 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  44.23 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  43.87 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  43.29 
 
 		 464 aa  329  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  44.7 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  42.79 
 
 		 458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  42.89 
 
 		 471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  43.2 
 
 		 443 aa  324  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  43.36 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  43.27 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  42.52 
 
 		 453 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  42.71 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  42.46 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  44.97 
 
 		 487 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  44.28 
 
 		 447 aa  316  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  44.97 
 
 		 454 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  42.79 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  43.92 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  43.35 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  43.57 
 
 		 490 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  41.31 
 
 		 479 aa  305  8.000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  39.36 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  38.9 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  39.68 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  38.84 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  42.12 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  41.6 
 
 		 479 aa  300  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  37.9 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  36.78 
 
 		 477 aa  292  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>