More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  72.25 
 
 		 471 aa  684    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  100 
 
 		 479 aa  949    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1002  amino acid carrier protein  70.81 
 
 		 482 aa  643    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.663557  normal  0.482987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  67.51 
 
 		 472 aa  601  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  59.88 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  53.56 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  49.66 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  49.33 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  46.41 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  46.79 
 
 		 462 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  46.37 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  44.69 
 
 		 469 aa  365  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  45.38 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  46.68 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  46.17 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  44.4 
 
 		 459 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  45.2 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  44.42 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  45.04 
 
 		 452 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  44.37 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  44.96 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  45.18 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  45.18 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  44.87 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  44.87 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  44.87 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  45.18 
 
 		 452 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  44.87 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  43.97 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  43.1 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  43.32 
 
 		 455 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  43.32 
 
 		 455 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  46.05 
 
 		 464 aa  346  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  46.55 
 
 		 435 aa  346  7e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  43.89 
 
 		 456 aa  345  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  44.09 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  43.32 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  43.1 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  43.1 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  43.1 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  45.13 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 455 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  44.98 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  45.42 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  45.17 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  44.26 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  43.45 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  45.89 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  45.37 
 
 		 447 aa  333  6e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  42.86 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  43.2 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  46.67 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  43.25 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  43.17 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  40.22 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  44.79 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  41.18 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  44.25 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  44.25 
 
 		 464 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  40.69 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  41.25 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  44.96 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  41.43 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  40.09 
 
 		 459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  40.51 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  44.37 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  40.26 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  40.57 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  40.26 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  40.26 
 
 		 458 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  40.26 
 
 		 458 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  40.7 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  42.25 
 
 		 505 aa  306  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  44.84 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  40.95 
 
 		 459 aa  306  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  39.43 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  41.25 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0373  amino acid carrier protein  39.7 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  42.79 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  41.79 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  41.36 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  41.7 
 
 		 492 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  42.15 
 
 		 498 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  42.43 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  44.26 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  43.01 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  42.12 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  40.97 
 
 		 490 aa  289  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  41.79 
 
 		 456 aa  289  9e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  39.66 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  36.93 
 
 		 503 aa  285  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  41.16 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  42.55 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  37.02 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  40.17 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  38.32 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  40.26 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>