More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0373 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0373  amino acid carrier protein  100 
 
 		 460 aa  927    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  52.61 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  45.18 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  45.39 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  42.49 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  40.26 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  39.53 
 
 		 460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  40.26 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  40.47 
 
 		 458 aa  322  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  41.23 
 
 		 479 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  40.61 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  40.7 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  40.39 
 
 		 455 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  40.47 
 
 		 479 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  41.87 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  41.65 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 455 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  42.57 
 
 		 455 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  40.17 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 455 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  39.96 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  39.96 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  39.96 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  40.47 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  39.61 
 
 		 455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  40.04 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  38.6 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  39.31 
 
 		 472 aa  302  8.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  40.13 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  39.57 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  41.89 
 
 		 435 aa  299  9e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  40.49 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  38.6 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  39.25 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  38.39 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  39.25 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  37.94 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  39.91 
 
 		 456 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  39.25 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  39.25 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  38.82 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  39.44 
 
 		 445 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1002  amino acid carrier protein  39.21 
 
 		 482 aa  296  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.663557  normal  0.482987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  38.6 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  38.38 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  38.35 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  40.18 
 
 		 424 aa  295  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  39.4 
 
 		 447 aa  294  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  39.87 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  38.18 
 
 		 457 aa  292  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  38.01 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  38.31 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  37.2 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  40.3 
 
 		 443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  38.01 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  38.25 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  39.96 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  40 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0673  amino acid carrier protein  37.2 
 
 		 470 aa  279  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000329208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  36.75 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  36.62 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  38.13 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  37.5 
 
 		 456 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  38.58 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  38.44 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  40.09 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  35.99 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  36.54 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  36.85 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  39.26 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  36.62 
 
 		 451 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  37.79 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  36.11 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  36.32 
 
 		 458 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  36.32 
 
 		 458 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  37.42 
 
 		 459 aa  269  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  36.11 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  37.34 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  37.63 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  36.67 
 
 		 459 aa  266  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  37.28 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  35.96 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  38.63 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  35.53 
 
 		 469 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  36.66 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  36.06 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  33.94 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  36.88 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  37.45 
 
 		 505 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  39.34 
 
 		 461 aa  257  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  39.75 
 
 		 487 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  33.7 
 
 		 457 aa  249  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  34.55 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  35.97 
 
 		 450 aa  246  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  34.87 
 
 		 452 aa  246  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  33.84 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  36.06 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  36.97 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  37.26 
 
 		 447 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>