More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2159 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  100 
 
 
460 aa  905    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  64.33 
 
 
456 aa  559  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  69.95 
 
 
426 aa  558  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  63.45 
 
 
462 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  62.89 
 
 
458 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  60.8 
 
 
460 aa  544  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  63.23 
 
 
462 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  63.11 
 
 
458 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  61.64 
 
 
463 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  61.76 
 
 
452 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  61.99 
 
 
452 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  64.73 
 
 
456 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  61.99 
 
 
452 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  63.06 
 
 
468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  61.99 
 
 
452 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  62.13 
 
 
452 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  62.13 
 
 
452 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  59.5 
 
 
464 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  62.13 
 
 
452 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  62.13 
 
 
452 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  61.31 
 
 
452 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  60.58 
 
 
459 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  61.02 
 
 
457 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  60.09 
 
 
456 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  60.49 
 
 
457 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  57.91 
 
 
448 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  57.01 
 
 
447 aa  474  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  63.66 
 
 
458 aa  458  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  55.6 
 
 
445 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  51.89 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  53.5 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  51.45 
 
 
455 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  51.45 
 
 
455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  51.45 
 
 
455 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  51.45 
 
 
455 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  51.67 
 
 
455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  51.45 
 
 
455 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  51.58 
 
 
455 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  51.58 
 
 
455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  51.45 
 
 
455 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  52.8 
 
 
455 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  51.69 
 
 
460 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  50.9 
 
 
457 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  50.34 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  51.8 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  50.99 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  50.34 
 
 
457 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  49.66 
 
 
453 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  49.57 
 
 
505 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  50 
 
 
458 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  51.23 
 
 
453 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  50.9 
 
 
456 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  51.23 
 
 
453 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  50.23 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  48.46 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  52.47 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  50.22 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  50.34 
 
 
458 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  49.66 
 
 
459 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  50.34 
 
 
458 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  50.34 
 
 
458 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  50.34 
 
 
458 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  50.91 
 
 
435 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  51.8 
 
 
459 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  50.23 
 
 
443 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  50.68 
 
 
476 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  48.1 
 
 
498 aa  391  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  48.28 
 
 
458 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  49.1 
 
 
449 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  48.63 
 
 
449 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  49.56 
 
 
459 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
492 aa  382  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  47.95 
 
 
464 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  47.74 
 
 
448 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  50.7 
 
 
424 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  46.22 
 
 
458 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  49.55 
 
 
446 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  49.89 
 
 
461 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  46.73 
 
 
447 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  47.74 
 
 
443 aa  362  6e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  48.05 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  46.68 
 
 
471 aa  360  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  46.88 
 
 
470 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  47.3 
 
 
464 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  46.26 
 
 
458 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  46.5 
 
 
460 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  48.11 
 
 
454 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  47.54 
 
 
452 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  41.93 
 
 
458 aa  345  7e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  50.62 
 
 
487 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  46.51 
 
 
490 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  46.41 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  46.05 
 
 
450 aa  340  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  44.42 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  42.95 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  45.51 
 
 
479 aa  335  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  44.37 
 
 
467 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  43.32 
 
 
472 aa  329  8e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  41.74 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  42.01 
 
 
472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>