More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0040 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  100 
 
 
469 aa  944    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  53.52 
 
 
460 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  54.79 
 
 
441 aa  477  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  55.17 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  48.7 
 
 
471 aa  428  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  48.05 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  50.33 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  46.59 
 
 
455 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  44.69 
 
 
479 aa  388  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  46.15 
 
 
455 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  44.78 
 
 
460 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  45.93 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  45.26 
 
 
472 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  45.93 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.71 
 
 
455 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1002  amino acid carrier protein  45.19 
 
 
482 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.663557  normal  0.482987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  46.29 
 
 
455 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  45.93 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  46.19 
 
 
457 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  45.93 
 
 
455 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  46.29 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  45.93 
 
 
455 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  48.99 
 
 
445 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  49.32 
 
 
455 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  45.78 
 
 
456 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  45.54 
 
 
460 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  45.85 
 
 
457 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  44.8 
 
 
479 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  48.19 
 
 
445 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  45.75 
 
 
459 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  43.41 
 
 
462 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  43.2 
 
 
462 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  48.31 
 
 
468 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  44.01 
 
 
458 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  44.01 
 
 
458 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  44.49 
 
 
458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  47.09 
 
 
443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  43.79 
 
 
458 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  43.79 
 
 
458 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  43.45 
 
 
456 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  44.93 
 
 
459 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  45.08 
 
 
452 aa  359  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  45.18 
 
 
464 aa  359  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  49.21 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  45.59 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  45.08 
 
 
452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  49.55 
 
 
453 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  44.15 
 
 
459 aa  356  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  46.71 
 
 
448 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  49.32 
 
 
453 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  45.31 
 
 
452 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  47.66 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  45.11 
 
 
453 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  44.85 
 
 
452 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  45.08 
 
 
452 aa  352  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  43.33 
 
 
458 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  45.43 
 
 
457 aa  349  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  43.81 
 
 
457 aa  349  7e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  45.62 
 
 
464 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  44.7 
 
 
456 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  45.66 
 
 
449 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  43.67 
 
 
452 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  43.67 
 
 
452 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  43.67 
 
 
452 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  44.3 
 
 
447 aa  345  7e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  43.67 
 
 
452 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  45.39 
 
 
459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  43.2 
 
 
458 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  41.7 
 
 
458 aa  342  7e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  45.62 
 
 
456 aa  341  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  48.83 
 
 
435 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  45.23 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  45.96 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  47.24 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.27 
 
 
426 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  44.94 
 
 
446 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  42.95 
 
 
476 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  45.57 
 
 
470 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  43.62 
 
 
459 aa  330  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  46.41 
 
 
460 aa  328  9e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  48.82 
 
 
424 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  42.7 
 
 
458 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  46.73 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  47.97 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  41.88 
 
 
505 aa  315  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  41.52 
 
 
460 aa  315  8e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  43.15 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0373  amino acid carrier protein  39.61 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  44.26 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  43.07 
 
 
490 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  42.26 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  36.93 
 
 
503 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  44.3 
 
 
472 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  41.14 
 
 
457 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  40.09 
 
 
458 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  43.37 
 
 
447 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  40.99 
 
 
456 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  42.22 
 
 
452 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  41.46 
 
 
492 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  41.92 
 
 
458 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>