More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3765 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3765  sodium:alanine symporter  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.318841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  78.77 
 
 		 454 aa  286  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  70 
 
 		 477 aa  250  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  54.4 
 
 		 456 aa  193  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  48.63 
 
 		 433 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  37.28 
 
 		 449 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  40 
 
 		 461 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  38.18 
 
 		 448 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  36.26 
 
 		 467 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  36.09 
 
 		 456 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  37.95 
 
 		 456 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  39.16 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  32.98 
 
 		 524 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  34.91 
 
 		 458 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  34.32 
 
 		 457 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  37.28 
 
 		 453 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  33.99 
 
 		 455 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  34.32 
 
 		 459 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  35.9 
 
 		 443 aa  109  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  33.33 
 
 		 542 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  35.5 
 
 		 459 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  33.73 
 
 		 458 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  33.73 
 
 		 458 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  33.73 
 
 		 458 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  33.73 
 
 		 458 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  31.38 
 
 		 502 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  38.32 
 
 		 464 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  33.16 
 
 		 502 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  31.98 
 
 		 472 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  33.14 
 
 		 457 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  33.33 
 
 		 498 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  35.15 
 
 		 460 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  34.62 
 
 		 441 aa  104  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  30.73 
 
 		 499 aa  104  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  36.69 
 
 		 449 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  32.69 
 
 		 448 aa  104  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  36.54 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  36.54 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  35.2 
 
 		 447 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  35.19 
 
 		 492 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  36.54 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  36.54 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  35.03 
 
 		 446 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  35.45 
 
 		 509 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  32.54 
 
 		 459 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  35.9 
 
 		 452 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  33.51 
 
 		 435 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  33.76 
 
 		 447 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  34.39 
 
 		 443 aa  99.4  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  35.48 
 
 		 452 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  34.84 
 
 		 452 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  32.04 
 
 		 553 aa  98.2  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  33.77 
 
 		 462 aa  98.2  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  35.48 
 
 		 459 aa  98.2  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  33.77 
 
 		 462 aa  98.2  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  32.45 
 
 		 453 aa  97.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  35.48 
 
 		 452 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  34.84 
 
 		 452 aa  97.1  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  34.13 
 
 		 458 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  34.78 
 
 		 464 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  28.72 
 
 		 504 aa  97.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  31.91 
 
 		 453 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  32.48 
 
 		 458 aa  95.9  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  30.54 
 
 		 459 aa  94.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  36.13 
 
 		 452 aa  95.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  32.3 
 
 		 505 aa  93.2  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  33.33 
 
 		 456 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  29.38 
 
 		 481 aa  92.8  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  30.43 
 
 		 498 aa  92  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  32.94 
 
 		 424 aa  92  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  35.54 
 
 		 443 aa  92  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  30.32 
 
 		 470 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  34.19 
 
 		 459 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  32.45 
 
 		 512 aa  91.3  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  34.97 
 
 		 456 aa  91.7  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  33.52 
 
 		 464 aa  91.3  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  36.03 
 
 		 460 aa  91.3  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  30.32 
 
 		 470 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  33.13 
 
 		 471 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  31.37 
 
 		 463 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  30.59 
 
 		 513 aa  90.1  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  31.35 
 
 		 458 aa  90.1  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  31.55 
 
 		 466 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  31.55 
 
 		 466 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  32.43 
 
 		 523 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  34.15 
 
 		 457 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  32.69 
 
 		 457 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  32.92 
 
 		 458 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  35.29 
 
 		 558 aa  89.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  31.41 
 
 		 445 aa  89  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  34.24 
 
 		 458 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  34.38 
 
 		 460 aa  88.2  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  32.91 
 
 		 456 aa  87.8  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  27.45 
 
 		 445 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  32.67 
 
 		 426 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  31.85 
 
 		 460 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  31.17 
 
 		 464 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  26.74 
 
 		 454 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  32.18 
 
 		 493 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  30.13 
 
 		 455 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>