More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1450 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1450  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0991  Di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  67.59 
 
 
220 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00019103  hitchhiker  0.0000468071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2346  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  61.01 
 
 
223 aa  293  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0014458  normal  0.0426929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1809  putative undecaprenyl diphosphate synthase  61.5 
 
 
213 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00748094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1528  undecaprenyl diphosphate synthase, putative  60.56 
 
 
213 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.496423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14480  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  61.21 
 
 
214 aa  280  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  32.03 
 
 
250 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  31.76 
 
 
249 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  29.31 
 
 
257 aa  121  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  31.76 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  30.87 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  32.46 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  30.4 
 
 
240 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  30.74 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.34 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  29.91 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  28.57 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  28.7 
 
 
245 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.91 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  30 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  30.34 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30.74 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30.74 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.57 
 
 
249 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  30.74 
 
 
275 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.06 
 
 
252 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  29.49 
 
 
285 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  29.87 
 
 
256 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  30.3 
 
 
275 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  30.3 
 
 
275 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  30.3 
 
 
275 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.45 
 
 
276 aa  111  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30.3 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  30.94 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.69 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  29 
 
 
264 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  32.75 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29 
 
 
259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  28.82 
 
 
282 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  29.18 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  28.51 
 
 
276 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  28.76 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  29.44 
 
 
275 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  27.63 
 
 
242 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29 
 
 
241 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  27.83 
 
 
240 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  30.3 
 
 
288 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.45 
 
 
248 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  30.26 
 
 
231 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  28.09 
 
 
280 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  28.02 
 
 
265 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  28.63 
 
 
251 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.83 
 
 
253 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.83 
 
 
253 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  28.88 
 
 
266 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.59 
 
 
267 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  27.39 
 
 
260 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.26 
 
 
258 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  27.9 
 
 
294 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.08 
 
 
252 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  28.51 
 
 
276 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.88 
 
 
266 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  27.83 
 
 
271 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  29.02 
 
 
266 aa  104  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  29.6 
 
 
263 aa  104  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 
241 aa  104  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  29.79 
 
 
249 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  29.18 
 
 
252 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 
264 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  29.07 
 
 
250 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  27.07 
 
 
251 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.07 
 
 
251 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  32.43 
 
 
230 aa  103  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.83 
 
 
251 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  27.07 
 
 
251 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.83 
 
 
237 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.13 
 
 
282 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  27.83 
 
 
237 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.08 
 
 
253 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  28.7 
 
 
251 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  27.66 
 
 
260 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  28.26 
 
 
256 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.59 
 
 
249 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.83 
 
 
260 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  26.29 
 
 
256 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  28.57 
 
 
250 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  27.78 
 
 
253 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  26.72 
 
 
267 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.47 
 
 
267 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  28.7 
 
 
251 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.35 
 
 
247 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  28.26 
 
 
264 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  28.7 
 
 
251 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  27.39 
 
 
263 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.08 
 
 
252 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  28.12 
 
 
274 aa  101  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.59 
 
 
246 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  27.95 
 
 
264 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  28.33 
 
 
260 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  28.31 
 
 
252 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>