More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1809 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1809  putative undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00748094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1528  undecaprenyl diphosphate synthase, putative  98.12 
 
 
213 aa  430  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.496423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2346  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  61.32 
 
 
223 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0014458  normal  0.0426929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14480  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  63.55 
 
 
214 aa  291  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0991  Di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  61.03 
 
 
220 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00019103  hitchhiker  0.0000468071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1450  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  61.5 
 
 
219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.62 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.33 
 
 
267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  27.19 
 
 
257 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.19 
 
 
249 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.57 
 
 
251 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  31 
 
 
248 aa  114  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.17 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.6 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  28.07 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.48 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.05 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  29.91 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  29.74 
 
 
249 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  29 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  28.02 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.21 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  29.91 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  27.39 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  28.7 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.17 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.64 
 
 
251 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.88 
 
 
252 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.94 
 
 
258 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.88 
 
 
252 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.88 
 
 
252 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  28.26 
 
 
254 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  27.59 
 
 
271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  29.07 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29 
 
 
241 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.33 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.33 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  27.71 
 
 
250 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  29.82 
 
 
244 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.31 
 
 
256 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  29.74 
 
 
249 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  29.87 
 
 
266 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  30.84 
 
 
232 aa  106  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  29.61 
 
 
249 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.33 
 
 
279 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  27.39 
 
 
263 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.96 
 
 
257 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  27.59 
 
 
276 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  31.42 
 
 
245 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  27.39 
 
 
264 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.8 
 
 
246 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  31.74 
 
 
241 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  28.51 
 
 
259 aa  105  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.13 
 
 
252 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.17 
 
 
267 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  26.61 
 
 
282 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  28.32 
 
 
258 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  28.32 
 
 
258 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  30.04 
 
 
258 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  29.91 
 
 
252 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  31.42 
 
 
231 aa  104  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  25.65 
 
 
275 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  27.95 
 
 
253 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  25.65 
 
 
275 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  27.39 
 
 
258 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  30.57 
 
 
253 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  25.65 
 
 
275 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  29.49 
 
 
280 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  27.27 
 
 
262 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  28.57 
 
 
233 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  28.76 
 
 
250 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  27.39 
 
 
256 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  29.87 
 
 
271 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  26.96 
 
 
253 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
238 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.19 
 
 
253 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.19 
 
 
253 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  27.95 
 
 
253 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  28.32 
 
 
258 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  25.33 
 
 
260 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  29.13 
 
 
233 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  25.76 
 
 
260 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  28.45 
 
 
258 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  26.96 
 
 
254 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  31.53 
 
 
253 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  29.36 
 
 
278 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  27.27 
 
 
285 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 
268 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  27.31 
 
 
242 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  29.44 
 
 
252 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  28.7 
 
 
252 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.14 
 
 
254 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  30.09 
 
 
225 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  29.44 
 
 
259 aa  102  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  28.38 
 
 
247 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  28.14 
 
 
240 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  26.87 
 
 
261 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>