144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1293 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1293  DNA invertase/resolvase  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00017233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1298  resolvase domain-containing protein  97.42 
 
 		 205 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0238352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  32.91 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1283  DNA invertase/resolvase  32.58 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000215115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  31.15 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  29.41 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  27.92 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  27.74 
 
 		 412 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  28.86 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  28.86 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.22 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  28.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.41 
 
 		 515 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  31.37 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  28.65 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 		 546 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 460 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.85 
 
 		 546 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  27.84 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  28.74 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  29.06 
 
 		 506 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  28.4 
 
 		 502 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 441 aa  51.6  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 415 aa  51.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.1 
 
 		 525 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  25 
 
 		 522 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.27 
 
 		 545 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.48 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 554 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  24.79 
 
 		 462 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  24.79 
 
 		 462 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.83 
 
 		 522 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 445 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.4 
 
 		 527 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  23.97 
 
 		 343 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.45 
 
 		 525 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  27.93 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27 
 
 		 485 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  24.59 
 
 		 449 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.88 
 
 		 447 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 445 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.63 
 
 		 544 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 		 576 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 445 aa  48.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  25.22 
 
 		 532 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  24.17 
 
 		 550 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  25.9 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  22.7 
 
 		 467 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  26.62 
 
 		 299 aa  48.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  22.52 
 
 		 552 aa  47.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  21.97 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  23.9 
 
 		 460 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  29.21 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  32.41 
 
 		 578 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  32.41 
 
 		 601 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 511 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 		 568 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.79 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  25.51 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.2 
 
 		 426 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  30.7 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  30.7 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  29.57 
 
 		 309 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  26.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.45 
 
 		 443 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  33.33 
 
 		 552 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  32.08 
 
 		 551 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  32.08 
 
 		 662 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  26.28 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  28.09 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.09 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  25.34 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  22.76 
 
 		 537 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.12 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  23.58 
 
 		 534 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  28.68 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  30.19 
 
 		 569 aa  44.7  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  23.58 
 
 		 534 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  24.53 
 
 		 445 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.24 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.97 
 
 		 500 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.59 
 
 		 441 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 441 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  31.48 
 
 		 597 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  22.76 
 
 		 534 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  21.95 
 
 		 534 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  22.76 
 
 		 534 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>