156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1273 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1273  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 320 aa  670    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.390011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 800 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 465 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.53 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 450 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  27.16 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 385 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 465 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  23.26 
 
 		 479 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.2 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 450 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.2 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  26.35 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 445 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  33.08 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.51 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  22.84 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 461 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.33 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.2 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.2 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  22.03 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.06 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.95 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 433 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.46 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  21.71 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  25.73 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  22.12 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.95 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 451 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  23.56 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  21.91 
 
 		 397 aa  49.3  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.22 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0135  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000054409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 445 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  21.4 
 
 		 466 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.07 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  27.69 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 462 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  22.89 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.99 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  22.22 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 486 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.6 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.51 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.03 
 
 		 479 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  22.81 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  20.29 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  22.81 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  24.43 
 
 		 447 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.45 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03880  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.76 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.99 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  21.84 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  21.45 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.54 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  21.92 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  21.76 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>