More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1165 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  47.06 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  38.43 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  34.39 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  36.14 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  37 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  36.14 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  36.56 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  31.5 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  33.88 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  34.6 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  34.12 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  32.48 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  32.86 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  33.18 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  30.93 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  32.49 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  30.33 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  35.55 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  34.6 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  32.74 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  29.61 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  30.9 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  32.14 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  31.7 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  30.49 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  29.18 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0057  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.07 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  32.38 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  29.18 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  31.67 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  31.06 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.82 
 
 		 671 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  28.51 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  33.82 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  32.77 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  30.36 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  36.46 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  36.76 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  32.11 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  31.71 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  29.39 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  29.44 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  33.17 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  28.9 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  34.97 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.01 
 
 		 340 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  31 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0811  FeS assembly ATPase SufC  30.83 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0160025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  31.92 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  32.26 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  32.26 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 		 354 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2329  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.67 
 
 		 326 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000238837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.88 
 
 		 375 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  32.37 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.43 
 
 		 344 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  29.07 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  31.22 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 		 375 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33 
 
 		 362 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 		 375 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.21 
 
 		 371 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.4 
 
 		 369 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  32.52 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0402  FeS assembly ATPase SufC  31.47 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000798388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  28.99 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  29.82 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  28.99 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  29.07 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  30.67 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 		 354 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  31.67 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.9 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  31.67 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.21 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.69 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  31.42 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  29.47 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  30.77 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  31.39 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  30 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  30.74 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 314 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.21 
 
 		 359 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  29.28 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  30.26 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>