More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0914 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  540  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  87.55 
 
 		 258 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  82.06 
 
 		 260 aa  447  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  75.19 
 
 		 264 aa  407  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  75.79 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  74.51 
 
 		 255 aa  391  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  66.53 
 
 		 253 aa  345  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  62.4 
 
 		 254 aa  311  9e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  55.38 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  56 
 
 		 251 aa  281  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  56 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  55.6 
 
 		 251 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  55.65 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  54.44 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  51.81 
 
 		 245 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  51 
 
 		 246 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  54.03 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  52.21 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  49.6 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  50.4 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  48 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  48.79 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  49.19 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  49.6 
 
 		 246 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  39.45 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  34.88 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  33.06 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  33.06 
 
 		 228 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  34.29 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  34.77 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  35.43 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  38.46 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  34.11 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  38.08 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.29 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  34.39 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  35.25 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  35.02 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  36.05 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  36.29 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  35.55 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  32.64 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  34.1 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  34.17 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  37.08 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  37.08 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  37.08 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  37.08 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  37.08 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  37.08 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  37.08 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  33.98 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  33.95 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  33.33 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  35.88 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  35.42 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  32.44 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  32.1 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  37.92 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  32.73 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  35.42 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  36.67 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  36.67 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  33.85 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  34.2 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  33.85 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  33.08 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  36.67 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.46 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.85 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  32.81 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  36.25 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  35.27 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  35.83 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  34.87 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  35.83 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  31.95 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  34.38 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  35.83 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  36.21 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  35.83 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  36.44 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  35.83 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  34.75 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  34.98 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  32.68 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1744  FeS assembly ATPase SufC  30.97 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  32.82 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0760  FeS assembly ATPase SufC  30.86 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.107751  normal  0.952712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  34.36 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  35.42 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.77 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  33.46 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  36.02 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  33.46 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  30.37 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>