More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0177 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
252 aa  499  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1744  FeS assembly ATPase SufC  83.73 
 
 
254 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0760  FeS assembly ATPase SufC  82.54 
 
 
254 aa  434  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.107751  normal  0.952712 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0612  FeS assembly ATPase SufC  83.6 
 
 
258 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1841  ABC transporter related  52.63 
 
 
251 aa  265  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  46.8 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
256 aa  215  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  47.45 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  44.03 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  45.34 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  44.81 
 
 
246 aa  211  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
256 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  44.76 
 
 
251 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  47.37 
 
 
249 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  44.58 
 
 
249 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  43.15 
 
 
248 aa  208  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  44.31 
 
 
252 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  44.4 
 
 
253 aa  207  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  43.5 
 
 
252 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  45.42 
 
 
257 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  44 
 
 
251 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  43.78 
 
 
250 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  44.67 
 
 
250 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  45.06 
 
 
252 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  47.56 
 
 
257 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  45.49 
 
 
258 aa  206  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  44.67 
 
 
244 aa  205  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  44.72 
 
 
252 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  44.67 
 
 
250 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  44.17 
 
 
247 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  44.67 
 
 
250 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  44.26 
 
 
250 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  45.88 
 
 
259 aa  205  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.61 
 
 
253 aa  204  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.61 
 
 
255 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  43.67 
 
 
262 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  42.17 
 
 
251 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  43.5 
 
 
250 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  42.97 
 
 
249 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  43.85 
 
 
250 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  45.06 
 
 
264 aa  201  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  46.25 
 
 
252 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  44.92 
 
 
253 aa  202  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  44.67 
 
 
248 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  43.37 
 
 
249 aa  201  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  44.8 
 
 
252 aa  201  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  42.23 
 
 
256 aa  201  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  46.4 
 
 
257 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  44.62 
 
 
265 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  43.25 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.08 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  43.57 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  43.27 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  42.28 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  45.02 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  43.27 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  45.45 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  44.21 
 
 
244 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  43.5 
 
 
252 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  44.21 
 
 
244 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  44.84 
 
 
264 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  43.6 
 
 
254 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  46.03 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  42.4 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  42.86 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  42.29 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  42.8 
 
 
248 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  42.4 
 
 
250 aa  197  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  44.05 
 
 
253 aa  197  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  43.37 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  42.56 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  43.2 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  44.88 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  42.06 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  44.03 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  42.13 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  42.56 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  43.72 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  42.91 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  44.27 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  41.87 
 
 
248 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  42.39 
 
 
248 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  41.25 
 
 
256 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  41.67 
 
 
259 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  46.22 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  41.87 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  43.85 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  45.82 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  41.98 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  40.89 
 
 
250 aa  195  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  42.62 
 
 
251 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  41.2 
 
 
250 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  41.98 
 
 
248 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
250 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  43.39 
 
 
256 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  42.74 
 
 
261 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  42.21 
 
 
256 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  42.8 
 
 
251 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  45.42 
 
 
257 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  40.57 
 
 
253 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>