More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0496 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  96.84 
 
 
253 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  96.84 
 
 
253 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  80.65 
 
 
261 aa  424  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  80.65 
 
 
261 aa  424  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  80.65 
 
 
261 aa  424  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  80.65 
 
 
261 aa  424  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  80.65 
 
 
261 aa  424  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  80.24 
 
 
261 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  80.24 
 
 
261 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  80.24 
 
 
261 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  80.24 
 
 
261 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  80.24 
 
 
261 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  80.65 
 
 
261 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  77.42 
 
 
259 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  75 
 
 
259 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  75.81 
 
 
256 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 
256 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  70.56 
 
 
266 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 
256 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  70.87 
 
 
265 aa  377  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  67.21 
 
 
261 aa  350  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  65.32 
 
 
256 aa  347  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  62.5 
 
 
250 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  62.2 
 
 
252 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  63.31 
 
 
251 aa  329  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  61.32 
 
 
256 aa  329  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  65.04 
 
 
247 aa  325  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  64.88 
 
 
257 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 
250 aa  317  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  62.31 
 
 
260 aa  316  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  57.81 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  61.92 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  59.3 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 
257 aa  311  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 
249 aa  308  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  60.96 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  62.35 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  58.04 
 
 
256 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  56.8 
 
 
254 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
252 aa  301  8.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  56.56 
 
 
252 aa  300  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  56.15 
 
 
263 aa  300  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  60.08 
 
 
253 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  61.79 
 
 
262 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  60.16 
 
 
253 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  56.86 
 
 
256 aa  298  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
252 aa  298  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
252 aa  298  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  61.79 
 
 
265 aa  298  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  58.89 
 
 
263 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  58.89 
 
 
263 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  58.89 
 
 
263 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  60.16 
 
 
255 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  58.98 
 
 
259 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  55.6 
 
 
257 aa  295  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  59.76 
 
 
253 aa  294  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  56.5 
 
 
251 aa  294  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  60 
 
 
254 aa  294  9e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  57.14 
 
 
249 aa  294  9e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  60.08 
 
 
258 aa  294  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  56.5 
 
 
248 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
253 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  60.41 
 
 
255 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.3 
 
 
253 aa  292  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  55.69 
 
 
250 aa  292  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  58.06 
 
 
257 aa  292  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.13 
 
 
253 aa  291  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.13 
 
 
251 aa  291  9e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  55.47 
 
 
264 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  59.51 
 
 
258 aa  290  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  54.4 
 
 
261 aa  289  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 
250 aa  288  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  56.57 
 
 
267 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  56.64 
 
 
257 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 
253 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  56.45 
 
 
266 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  54.4 
 
 
264 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  59.35 
 
 
252 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  58.7 
 
 
259 aa  285  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  56.25 
 
 
247 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  55.02 
 
 
252 aa  285  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  54.92 
 
 
248 aa  284  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  55.69 
 
 
255 aa  284  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  54.88 
 
 
261 aa  284  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  53.36 
 
 
257 aa  284  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  54.66 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  55.38 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  56.25 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  58.33 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  58.33 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  58.33 
 
 
250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  53.82 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  53.41 
 
 
262 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  58.75 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  53.82 
 
 
258 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  54.22 
 
 
252 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  54.88 
 
 
260 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  53.39 
 
 
254 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>