More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2915 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
252 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  79.76 
 
 
259 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  81.35 
 
 
253 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  82.73 
 
 
252 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  80.56 
 
 
252 aa  417  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  80.16 
 
 
253 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  81.93 
 
 
267 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  78.57 
 
 
251 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  79.76 
 
 
253 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  78.63 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  78.71 
 
 
252 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  77.02 
 
 
265 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  76.19 
 
 
257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  75 
 
 
257 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  75.79 
 
 
256 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  76.71 
 
 
255 aa  400  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  75.79 
 
 
253 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  77.6 
 
 
258 aa  398  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  75.2 
 
 
257 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  74.3 
 
 
264 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  74.6 
 
 
256 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  75.1 
 
 
260 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  72.29 
 
 
255 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  72.87 
 
 
263 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  72.87 
 
 
263 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  72.87 
 
 
263 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  74.19 
 
 
257 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  75.89 
 
 
264 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  73.68 
 
 
257 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  73.33 
 
 
266 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  72.18 
 
 
254 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  71.43 
 
 
249 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  72.29 
 
 
252 aa  367  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  69.88 
 
 
253 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  67.47 
 
 
258 aa  364  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  68.27 
 
 
259 aa  362  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  69.08 
 
 
253 aa  361  6e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  67.86 
 
 
255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 
261 aa  293  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
261 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
261 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
261 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
261 aa  292  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 
261 aa  292  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
261 aa  292  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 
259 aa  292  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
261 aa  292  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 
261 aa  292  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
261 aa  292  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
261 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  58.63 
 
 
257 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
259 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  59.67 
 
 
261 aa  285  7e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  56.86 
 
 
260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  56.47 
 
 
263 aa  279  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  56.08 
 
 
260 aa  278  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  56.97 
 
 
250 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  55.47 
 
 
256 aa  275  7e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  55.24 
 
 
252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  51.21 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  56.18 
 
 
259 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 
256 aa  271  9e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  50.81 
 
 
250 aa  270  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  56.73 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  53.04 
 
 
266 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  54.03 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  55.06 
 
 
261 aa  265  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  54.58 
 
 
251 aa  265  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 
250 aa  265  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
253 aa  265  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  56.91 
 
 
247 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  55.38 
 
 
252 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  56.1 
 
 
252 aa  263  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  53.66 
 
 
251 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  50.2 
 
 
248 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  54.25 
 
 
247 aa  262  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  52.19 
 
 
248 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  53.63 
 
 
256 aa  262  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  54.12 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  52.4 
 
 
255 aa  261  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  54.62 
 
 
257 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  53.82 
 
 
263 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  53.39 
 
 
251 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  51.76 
 
 
281 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  52.02 
 
 
261 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  53.7 
 
 
257 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  52.61 
 
 
263 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 
250 aa  257  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  52.61 
 
 
263 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  55.38 
 
 
252 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  53.6 
 
 
254 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  50.6 
 
 
250 aa  255  5e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  54.59 
 
 
262 aa  254  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  52.17 
 
 
251 aa  254  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  54.13 
 
 
262 aa  254  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  52.63 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>