More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2960 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  87.35 
 
 
253 aa  454  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  75.89 
 
 
255 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  76.31 
 
 
257 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  74.7 
 
 
259 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  75.2 
 
 
257 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  70.24 
 
 
253 aa  380  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  71.43 
 
 
263 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  73.52 
 
 
249 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  71.43 
 
 
263 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  72.73 
 
 
256 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  72.33 
 
 
256 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  71.43 
 
 
263 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  73.31 
 
 
253 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  72.69 
 
 
251 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  72.73 
 
 
257 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  73.15 
 
 
257 aa  377  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  72.33 
 
 
257 aa  374  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  72.91 
 
 
252 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  70.75 
 
 
252 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  68.65 
 
 
264 aa  370  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  71.49 
 
 
255 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  70.8 
 
 
260 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  71.76 
 
 
258 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  71.31 
 
 
267 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  69.57 
 
 
254 aa  367  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  70.47 
 
 
264 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  68.77 
 
 
253 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  69.96 
 
 
252 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  69.57 
 
 
255 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  69.88 
 
 
252 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  68.77 
 
 
258 aa  363  1e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  69.96 
 
 
266 aa  361  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  70.16 
 
 
262 aa  359  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  69.17 
 
 
253 aa  358  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  69.35 
 
 
265 aa  357  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  64.82 
 
 
259 aa  347  8e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  71.15 
 
 
252 aa  347  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  60.73 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  60.16 
 
 
253 aa  299  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 
261 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
261 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  60.78 
 
 
261 aa  296  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 
261 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
261 aa  295  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  60.78 
 
 
261 aa  295  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  60.78 
 
 
261 aa  295  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  60.78 
 
 
261 aa  295  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  60.34 
 
 
261 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 
261 aa  295  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  60.78 
 
 
261 aa  295  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  58.73 
 
 
259 aa  294  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  60.09 
 
 
257 aa  292  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  58.96 
 
 
253 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  58.96 
 
 
253 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  59.4 
 
 
259 aa  291  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  59.41 
 
 
250 aa  281  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  58.4 
 
 
256 aa  278  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  56 
 
 
251 aa  275  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  57.6 
 
 
254 aa  275  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  55.87 
 
 
256 aa  275  7e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  56.8 
 
 
260 aa  274  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  56.68 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  57.81 
 
 
260 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  54.81 
 
 
263 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  55.87 
 
 
252 aa  272  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  51.61 
 
 
248 aa  272  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  58.05 
 
 
259 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  56.33 
 
 
266 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  55.02 
 
 
253 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  53.75 
 
 
256 aa  268  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  54.76 
 
 
256 aa  268  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  55.42 
 
 
257 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  55.17 
 
 
252 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  53.64 
 
 
262 aa  265  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  55.2 
 
 
247 aa  265  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  54 
 
 
251 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  54.37 
 
 
253 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  53.57 
 
 
261 aa  262  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  51.29 
 
 
250 aa  262  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  56 
 
 
265 aa  262  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
250 aa  261  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  56 
 
 
263 aa  261  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  54.51 
 
 
262 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  51.03 
 
 
257 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  47.62 
 
 
248 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  56.2 
 
 
257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  54.74 
 
 
250 aa  258  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  52.34 
 
 
248 aa  258  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  51.21 
 
 
246 aa  258  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  53.41 
 
 
250 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  53.88 
 
 
250 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  53.01 
 
 
250 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  53.01 
 
 
250 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  52.26 
 
 
251 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  53.69 
 
 
261 aa  255  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  54.07 
 
 
247 aa  254  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  52.61 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  53.04 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  52.78 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>