More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04455 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  82.19 
 
 
248 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  78.78 
 
 
246 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  72.87 
 
 
255 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 
253 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  72.87 
 
 
250 aa  371  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  70.56 
 
 
251 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  68.42 
 
 
252 aa  359  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  67.6 
 
 
254 aa  355  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  66.27 
 
 
249 aa  350  1e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  64.37 
 
 
254 aa  346  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  65.16 
 
 
253 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  63.86 
 
 
261 aa  338  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  64.63 
 
 
258 aa  334  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  63.31 
 
 
262 aa  332  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  63.05 
 
 
260 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  63.52 
 
 
244 aa  331  6e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  63.52 
 
 
244 aa  331  6e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  62.5 
 
 
254 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 
250 aa  328  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  61.94 
 
 
250 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  60.57 
 
 
250 aa  323  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  63.37 
 
 
262 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  62.5 
 
 
271 aa  323  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  62.3 
 
 
261 aa  322  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  60.16 
 
 
250 aa  322  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  62.96 
 
 
251 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  62 
 
 
251 aa  321  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 
261 aa  321  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  64.29 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  60.24 
 
 
280 aa  319  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  63.11 
 
 
256 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  59.04 
 
 
257 aa  318  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
280 aa  317  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  59.92 
 
 
250 aa  317  9e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  61.69 
 
 
249 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  60.73 
 
 
249 aa  316  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 
256 aa  316  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  59.02 
 
 
263 aa  315  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.6 
 
 
251 aa  315  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  60.8 
 
 
251 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  60.62 
 
 
273 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  63.22 
 
 
248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  61.32 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  59.44 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  61.38 
 
 
256 aa  311  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  61.38 
 
 
256 aa  311  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 
251 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  57.89 
 
 
262 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  60.58 
 
 
249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  58.7 
 
 
261 aa  308  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
261 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  60.48 
 
 
250 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 
252 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 
261 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 
252 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 
257 aa  307  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  61 
 
 
250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  59.44 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  61.89 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  60.91 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  59.44 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  58.3 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  60.82 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  60.32 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  59.44 
 
 
261 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  58.7 
 
 
248 aa  305  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
261 aa  305  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  59.27 
 
 
249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  58.7 
 
 
248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  60.8 
 
 
259 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  59.34 
 
 
249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  58.3 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  57.49 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  59.67 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  58.3 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  56.91 
 
 
261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
262 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  60 
 
 
259 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 
268 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  56.75 
 
 
264 aa  300  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  59.02 
 
 
248 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  59.02 
 
 
248 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  56.68 
 
 
262 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  59.02 
 
 
268 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  59.02 
 
 
268 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  57.54 
 
 
263 aa  298  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  56.68 
 
 
248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  56.68 
 
 
248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  56.68 
 
 
248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  56.68 
 
 
248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  56.68 
 
 
248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  61.32 
 
 
252 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>