More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3039 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  80.72 
 
 		 253 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  79.76 
 
 		 251 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  76.21 
 
 		 252 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  74.7 
 
 		 254 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  75.81 
 
 		 250 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  72.87 
 
 		 250 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  74.09 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  71.95 
 
 		 249 aa  368  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  68.11 
 
 		 254 aa  364  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  70.9 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  68.7 
 
 		 271 aa  352  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  66.39 
 
 		 250 aa  351  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  67.21 
 
 		 244 aa  350  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  67.21 
 
 		 244 aa  350  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  65.57 
 
 		 250 aa  349  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  67.34 
 
 		 249 aa  349  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 256 aa  347  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  66.4 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  65.99 
 
 		 248 aa  345  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  65.32 
 
 		 254 aa  345  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 		 254 aa  345  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  65.99 
 
 		 248 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 253 aa  343  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  65.32 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  64.37 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  63.78 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  66.39 
 
 		 258 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  65.85 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  65.59 
 
 		 250 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 		 280 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  65.99 
 
 		 248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  65.45 
 
 		 248 aa  338  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 261 aa  337  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  63.56 
 
 		 262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  65.59 
 
 		 261 aa  333  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  63.89 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  62.35 
 
 		 248 aa  331  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  62.35 
 
 		 248 aa  331  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  62.35 
 
 		 248 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  62.35 
 
 		 248 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 		 248 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 		 248 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 		 248 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  62.35 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  62.35 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  62.35 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  61.94 
 
 		 261 aa  329  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  60.89 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  60.89 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  65.13 
 
 		 249 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 		 273 aa  324  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  64.46 
 
 		 247 aa  324  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  64.32 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  65.16 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  65.56 
 
 		 249 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  61.35 
 
 		 251 aa  321  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 		 263 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 262 aa  318  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  61.54 
 
 		 250 aa  318  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  60.66 
 
 		 261 aa  318  6e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  63.82 
 
 		 264 aa  317  7.999999999999999e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  61.04 
 
 		 257 aa  315  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 		 251 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  61.73 
 
 		 262 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 262 aa  314  7e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  62.86 
 
 		 248 aa  314  9e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  63.27 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  61.73 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  59.61 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  60.91 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 261 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.64 
 
 		 251 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  58.63 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  60.98 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  58.7 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  59.2 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  59.43 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  63.11 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  60.47 
 
 		 260 aa  309  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  61.32 
 
 		 251 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  60.91 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  62.7 
 
 		 268 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  62.3 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0464  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 		 246 aa  306  3e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0904  FeS assembly ATPase SufC  62.6 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  59.26 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  59.27 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  62.39 
 
 		 243 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  59.35 
 
 		 247 aa  304  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  59.34 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  57.89 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>