More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1736 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  100 
 
 
261 aa  524  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  77.38 
 
 
262 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  79.37 
 
 
260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  74.33 
 
 
261 aa  401  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  74.43 
 
 
262 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  73.18 
 
 
262 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  73.73 
 
 
271 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  71.71 
 
 
256 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  72.27 
 
 
262 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  69.41 
 
 
256 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  69.41 
 
 
256 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  68.5 
 
 
263 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  68.9 
 
 
263 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  66.94 
 
 
260 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00831  ABC transporter, ATP binding component  66.53 
 
 
261 aa  358  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00841  ABC transporter, ATP binding component  65.74 
 
 
261 aa  358  6e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0074  FeS assembly ATPase SufC  65.48 
 
 
261 aa  354  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  66.27 
 
 
262 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  65.87 
 
 
263 aa  353  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00801  ABC transporter, ATP binding component  62.99 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.681309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  63.93 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  62.6 
 
 
250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  62.2 
 
 
250 aa  332  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  62.9 
 
 
250 aa  330  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  65.16 
 
 
253 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  68.27 
 
 
268 aa  327  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 
254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  63.82 
 
 
258 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  68.55 
 
 
268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  68.55 
 
 
268 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  63.01 
 
 
248 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  63.01 
 
 
248 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  63.01 
 
 
248 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  63.01 
 
 
248 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  62.3 
 
 
252 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  61.94 
 
 
249 aa  323  1e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  63.01 
 
 
248 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  62.3 
 
 
248 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  64.63 
 
 
249 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  62.3 
 
 
248 aa  322  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  62.3 
 
 
248 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  62.35 
 
 
256 aa  322  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  62.3 
 
 
248 aa  322  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  64.78 
 
 
261 aa  321  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 
248 aa  321  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 
248 aa  321  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 
248 aa  321  7e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  61.89 
 
 
248 aa  320  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  64.2 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  61.89 
 
 
248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  61.89 
 
 
248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  61.89 
 
 
248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 
255 aa  318  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  61.07 
 
 
251 aa  317  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 
280 aa  316  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  62.04 
 
 
280 aa  315  4e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  61.07 
 
 
254 aa  314  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  58.82 
 
 
257 aa  314  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  60.78 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  61.89 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  62.6 
 
 
257 aa  311  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  60.66 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0904  FeS assembly ATPase SufC  66.4 
 
 
272 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  60.56 
 
 
261 aa  311  9e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  61.48 
 
 
248 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  61.54 
 
 
247 aa  310  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  62.04 
 
 
247 aa  310  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  62.96 
 
 
251 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 
252 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  58.91 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  61.48 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  56.75 
 
 
261 aa  307  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  60.32 
 
 
250 aa  307  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  60.25 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  60.82 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  60.25 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  60 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  62.24 
 
 
250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  62.93 
 
 
251 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  60.25 
 
 
248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  59.2 
 
 
252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  59.11 
 
 
249 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  60.66 
 
 
244 aa  305  6e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 
244 aa  305  6e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  62.24 
 
 
249 aa  304  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  57.43 
 
 
259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  57.83 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  63.22 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  60.16 
 
 
254 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  57.94 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  61.51 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  56.97 
 
 
246 aa  301  7.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  61.16 
 
 
247 aa  301  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  63.79 
 
 
252 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  58.63 
 
 
252 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>