More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1663 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  91.24 
 
 		 260 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  78.8 
 
 		 267 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  76.08 
 
 		 255 aa  407  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  73.93 
 
 		 259 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  76.19 
 
 		 252 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  76.31 
 
 		 252 aa  394  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  74.8 
 
 		 253 aa  394  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  72.87 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  72.05 
 
 		 256 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  74.3 
 
 		 252 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  73.33 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  74 
 
 		 253 aa  387  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  73.6 
 
 		 249 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  73.33 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  74.7 
 
 		 252 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  74.19 
 
 		 262 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  72.51 
 
 		 251 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  72.48 
 
 		 258 aa  384  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  71.43 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  71.65 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  74.4 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  75.49 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  72.58 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  73.9 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  70.87 
 
 		 253 aa  374  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  69.29 
 
 		 263 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  69.29 
 
 		 263 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  69.29 
 
 		 263 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  68.65 
 
 		 253 aa  370  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  71.03 
 
 		 255 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  70.59 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  68.92 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  67.46 
 
 		 253 aa  362  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  66.27 
 
 		 254 aa  357  9e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  69.6 
 
 		 252 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  65.08 
 
 		 258 aa  351  5.9999999999999994e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  63.95 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  60.89 
 
 		 259 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  61.13 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  61.13 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  61.13 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  61.13 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  61.13 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  61.13 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  60.73 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  60.73 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  61.13 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  60.48 
 
 		 259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  59.04 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  55.47 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  57.48 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  54.69 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  54.69 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 		 263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  58.02 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  54.66 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  53.88 
 
 		 252 aa  278  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  55.43 
 
 		 256 aa  278  9e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  55.47 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  55.82 
 
 		 257 aa  274  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 256 aa  274  9e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  57.31 
 
 		 259 aa  274  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  54.03 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  56.1 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  57.03 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  54.62 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  53.82 
 
 		 253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  57.03 
 
 		 263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  53.04 
 
 		 248 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  52.8 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  56.4 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  57.32 
 
 		 252 aa  268  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  57.32 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  50.2 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  54.22 
 
 		 250 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  53.41 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  53.6 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  56.28 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  54.4 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  57.09 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  53.54 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  53.23 
 
 		 261 aa  264  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  55.47 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  52.76 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  56.4 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  48.99 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  56.4 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  56.1 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  54.88 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  57.32 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>