More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3354 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  74.7 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  72.18 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  71.08 
 
 		 252 aa  377  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  71.66 
 
 		 253 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  68.15 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  68.83 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  69.35 
 
 		 250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  67.6 
 
 		 250 aa  355  5e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  67.89 
 
 		 249 aa  355  5e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  67.76 
 
 		 246 aa  354  8.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  66.53 
 
 		 249 aa  349  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  64.23 
 
 		 258 aa  345  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 253 aa  343  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  66.4 
 
 		 262 aa  342  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  63.56 
 
 		 260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  64.08 
 
 		 254 aa  335  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  64.75 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  64.75 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  61.42 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  64.34 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  63.78 
 
 		 256 aa  331  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  62.35 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  63.27 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  64.52 
 
 		 254 aa  329  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  328  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  61.2 
 
 		 250 aa  328  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  62.75 
 
 		 261 aa  328  8e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  60.4 
 
 		 250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  61.54 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  61.45 
 
 		 257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  63.82 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  64.63 
 
 		 271 aa  325  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  61.54 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  61.54 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  61.54 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  61.54 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  61.54 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  62.1 
 
 		 256 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  60.73 
 
 		 248 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  321  8e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  60.73 
 
 		 248 aa  321  8e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  63.31 
 
 		 280 aa  320  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  61.07 
 
 		 263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 		 280 aa  319  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  60.32 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  61.54 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  59.51 
 
 		 262 aa  316  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  59.92 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  59.92 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  59.13 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  59.51 
 
 		 250 aa  314  8e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  58.3 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  62.18 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  62.4 
 
 		 247 aa  309  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  61.79 
 
 		 264 aa  308  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.94 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  57.49 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  59.35 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.26 
 
 		 251 aa  305  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  58.8 
 
 		 251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  58.51 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  58.44 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  56.35 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  58.44 
 
 		 251 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  58.8 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  56.35 
 
 		 263 aa  301  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  56.22 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  58.57 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  60.33 
 
 		 247 aa  301  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0464  FeS assembly ATPase SufC  58.2 
 
 		 246 aa  301  1e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  58.75 
 
 		 268 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 251 aa  299  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  57.66 
 
 		 262 aa  299  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 		 268 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  58.02 
 
 		 280 aa  298  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  57.2 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  58.02 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  61.22 
 
 		 252 aa  297  9e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  56.35 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  56.98 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  57.08 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0904  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  56.5 
 
 		 251 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  56.05 
 
 		 259 aa  291  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>