More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0385 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  86.1 
 
 		 259 aa  457  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  75.4 
 
 		 253 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  75 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  73.52 
 
 		 255 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  73.39 
 
 		 252 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  74.19 
 
 		 252 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  72.06 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  71.37 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  71.66 
 
 		 262 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  72.47 
 
 		 257 aa  380  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  71.77 
 
 		 253 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  71.08 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  71.77 
 
 		 256 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  68.25 
 
 		 252 aa  371  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  71.37 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  68.77 
 
 		 253 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  68.02 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  70.28 
 
 		 257 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  70.68 
 
 		 257 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  70.63 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  69.6 
 
 		 257 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  70 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  66.15 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  67.82 
 
 		 263 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  67.82 
 
 		 263 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  67.46 
 
 		 253 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  67.82 
 
 		 263 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  67.47 
 
 		 252 aa  364  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  68.77 
 
 		 253 aa  363  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  68.48 
 
 		 255 aa  362  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  66.54 
 
 		 255 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  68.7 
 
 		 257 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  65.08 
 
 		 264 aa  351  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  67.06 
 
 		 266 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  65.86 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  66.13 
 
 		 249 aa  345  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  64.92 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  59.51 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  57.49 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  57.32 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  57.72 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  57.32 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  57.32 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  57.32 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 253 aa  288  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  57.89 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 253 aa  288  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  57.32 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  57.89 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  58.85 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  55.06 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  54.94 
 
 		 263 aa  278  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  55.95 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  55.37 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  56.92 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  57.03 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  55.82 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  56.52 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  54.37 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  56.1 
 
 		 251 aa  271  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  57.03 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  55.06 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  54.07 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  52.44 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  56.1 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  53.66 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  55.34 
 
 		 251 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  55.82 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  54.8 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  54.92 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  54.1 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  53.78 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  55.69 
 
 		 261 aa  264  8e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  54.72 
 
 		 251 aa  265  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 253 aa  265  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  53.39 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  53.39 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  53.01 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  53.39 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  51.92 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  54.37 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  55.06 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  53.39 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  56.05 
 
 		 253 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  52.9 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  56.05 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  53.63 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  53.75 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  51.43 
 
 		 251 aa  258  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  53.39 
 
 		 250 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>