More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4346 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 250 aa  506  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 250 aa  506  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  99.6 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  98.8 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  88.4 
 
 		 250 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  86 
 
 		 250 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  73.6 
 
 		 251 aa  374  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  69.88 
 
 		 252 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  70.28 
 
 		 252 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  69.88 
 
 		 252 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  70.49 
 
 		 250 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  70.08 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  68.8 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1607  FeS assembly ATPase SufC  74.18 
 
 		 249 aa  359  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00745955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  70.2 
 
 		 262 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  70.2 
 
 		 251 aa  355  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  68.03 
 
 		 249 aa  354  6.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  70.61 
 
 		 251 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  70.2 
 
 		 251 aa  354  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  70.2 
 
 		 251 aa  354  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  67.21 
 
 		 249 aa  349  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  69.39 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  69.39 
 
 		 280 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  66.53 
 
 		 251 aa  345  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  66.27 
 
 		 252 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  68.44 
 
 		 251 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 		 251 aa  341  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  67.33 
 
 		 253 aa  341  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  69.04 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  64 
 
 		 253 aa  333  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0811  FeS assembly ATPase SufC  66.12 
 
 		 251 aa  332  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0160025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  65.87 
 
 		 252 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 		 251 aa  329  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  65.08 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  63.52 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  61.85 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  63.22 
 
 		 247 aa  314  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  63.07 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  62.24 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  62.24 
 
 		 252 aa  307  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  58 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  60.58 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  61 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  56.63 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  60.74 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  59.34 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  57.85 
 
 		 253 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  59.6 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.68 
 
 		 249 aa  299  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  61 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  60.17 
 
 		 256 aa  296  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  57.14 
 
 		 256 aa  293  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  58.92 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  56.3 
 
 		 273 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  57.38 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  57.44 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  58.92 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  55.95 
 
 		 257 aa  289  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  57.02 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  56.79 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  57.44 
 
 		 248 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  58.26 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 		 257 aa  288  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  57.26 
 
 		 262 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  58.23 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  60.42 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  55.6 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 		 263 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  56.9 
 
 		 243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 		 261 aa  285  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  55.79 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  55.28 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  58.51 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  58.33 
 
 		 253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  55.37 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  55.79 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  55.79 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  58.33 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  56.38 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  56.2 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  55.65 
 
 		 264 aa  281  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  55.37 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  55.37 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  56.43 
 
 		 255 aa  281  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  55.37 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  57.92 
 
 		 253 aa  281  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  57.92 
 
 		 253 aa  281  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  56.61 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.09 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  56.2 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  56.4 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  57.08 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  54.96 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  55.19 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  55.19 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  58.92 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>