More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0099 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1607  FeS assembly ATPase SufC  80.16 
 
 
249 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00745955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  75.2 
 
 
250 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  75.2 
 
 
250 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  73.6 
 
 
250 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  73.6 
 
 
250 aa  374  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  73.6 
 
 
250 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  73.2 
 
 
250 aa  370  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  68.92 
 
 
252 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  66.93 
 
 
252 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  68.44 
 
 
252 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  67.6 
 
 
249 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  65.98 
 
 
249 aa  345  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  65.98 
 
 
251 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 
253 aa  345  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  65.98 
 
 
250 aa  345  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  68.15 
 
 
253 aa  345  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  66.13 
 
 
251 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  67.07 
 
 
251 aa  338  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.86 
 
 
251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  65.46 
 
 
251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  65.73 
 
 
262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  65.16 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  65.18 
 
 
251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  66.39 
 
 
248 aa  334  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  64.66 
 
 
251 aa  334  9e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  64.66 
 
 
280 aa  333  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  65.86 
 
 
251 aa  333  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  65.48 
 
 
252 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  64.66 
 
 
251 aa  328  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0811  FeS assembly ATPase SufC  63.45 
 
 
251 aa  327  8e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0160025  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  64.66 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  63.89 
 
 
254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  64.85 
 
 
249 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  65.08 
 
 
252 aa  315  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  64.68 
 
 
252 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  62.81 
 
 
247 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  64.66 
 
 
251 aa  308  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  57.65 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  61.83 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  59.75 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  61.41 
 
 
254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  59.2 
 
 
251 aa  301  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  59.75 
 
 
280 aa  300  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
280 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  58.68 
 
 
247 aa  298  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  60.17 
 
 
261 aa  297  9e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  60.17 
 
 
252 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  56.91 
 
 
253 aa  295  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  58.68 
 
 
247 aa  295  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  58.61 
 
 
247 aa  295  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  58.06 
 
 
254 aa  294  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  59.34 
 
 
248 aa  294  9e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 
253 aa  294  9e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.09 
 
 
249 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  57.6 
 
 
249 aa  293  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  58.96 
 
 
257 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  59.34 
 
 
258 aa  291  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  55.2 
 
 
261 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  56.45 
 
 
254 aa  288  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  56.57 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  56.68 
 
 
249 aa  285  5e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  55.6 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  58.3 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
254 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  56.4 
 
 
262 aa  280  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
271 aa  280  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  55.79 
 
 
250 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  57.26 
 
 
243 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  55.78 
 
 
260 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  56.43 
 
 
255 aa  279  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  59.17 
 
 
247 aa  278  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  55.02 
 
 
248 aa  278  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  55.6 
 
 
252 aa  278  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  55.37 
 
 
250 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  56.25 
 
 
260 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  58.4 
 
 
252 aa  277  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  54.22 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  54.22 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  54.22 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 
250 aa  276  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  55.47 
 
 
260 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  53.82 
 
 
248 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  53.82 
 
 
248 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  55.79 
 
 
248 aa  275  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  56.85 
 
 
261 aa  275  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 
263 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  52.57 
 
 
257 aa  275  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  55.2 
 
 
253 aa  274  8e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  56.45 
 
 
256 aa  274  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  53.2 
 
 
264 aa  274  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  55.34 
 
 
259 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  55.2 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  55.47 
 
 
261 aa  271  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
256 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
256 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  54.36 
 
 
248 aa  271  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  54.58 
 
 
262 aa  270  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>