More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3310 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
257 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  73.58 
 
 
247 aa  371  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  64.54 
 
 
251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  64.03 
 
 
249 aa  332  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  65.48 
 
 
248 aa  331  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  67.93 
 
 
251 aa  331  8e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  68.3 
 
 
249 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  63.41 
 
 
254 aa  324  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 
253 aa  323  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  65.81 
 
 
252 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  63.2 
 
 
251 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  66.81 
 
 
250 aa  321  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  61.11 
 
 
251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  62.06 
 
 
251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  66.67 
 
 
254 aa  316  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  64.08 
 
 
256 aa  316  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  64.14 
 
 
252 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  64.98 
 
 
252 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  64.53 
 
 
252 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  64.56 
 
 
251 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  64.04 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  65.07 
 
 
280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  64.63 
 
 
280 aa  311  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  64.02 
 
 
257 aa  310  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  58.69 
 
 
273 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  62.87 
 
 
252 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  62.93 
 
 
249 aa  308  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 
250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  61.35 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 
251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  59.22 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  59.29 
 
 
253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  58.5 
 
 
251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  58.27 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  58.5 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  65.38 
 
 
252 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  65.79 
 
 
261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  60.08 
 
 
249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  58.1 
 
 
251 aa  301  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.5 
 
 
251 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  61.7 
 
 
248 aa  301  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 
248 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  63.32 
 
 
258 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  61.29 
 
 
261 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  62.55 
 
 
248 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  56.92 
 
 
251 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  63.09 
 
 
248 aa  299  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  62.07 
 
 
249 aa  298  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  65.04 
 
 
268 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  64.63 
 
 
268 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  62.13 
 
 
248 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  62.13 
 
 
248 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  62.28 
 
 
255 aa  297  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  62.13 
 
 
248 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  62.13 
 
 
248 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  62.01 
 
 
248 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  59.83 
 
 
250 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  64.23 
 
 
268 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  60.24 
 
 
250 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  64.53 
 
 
252 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 
251 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  57.77 
 
 
248 aa  295  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  64.04 
 
 
248 aa  295  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  61.04 
 
 
253 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  62.01 
 
 
248 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  56.92 
 
 
280 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  58.37 
 
 
261 aa  294  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  63.6 
 
 
248 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  59.39 
 
 
250 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  63.6 
 
 
248 aa  292  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  57.87 
 
 
250 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  62.28 
 
 
250 aa  292  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  59.07 
 
 
261 aa  291  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  57.48 
 
 
250 aa  291  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  59.83 
 
 
262 aa  290  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
263 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  60.87 
 
 
248 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  59.35 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
250 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
250 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0904  FeS assembly ATPase SufC  61.79 
 
 
272 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  56.52 
 
 
249 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  62.11 
 
 
244 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  62.11 
 
 
244 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  61.11 
 
 
247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  57.96 
 
 
254 aa  285  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  59.39 
 
 
257 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  56.69 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  62.39 
 
 
260 aa  284  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  59.49 
 
 
256 aa  284  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  62.82 
 
 
252 aa  284  9e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  58.77 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>