More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0999 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  88.14 
 
 
254 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  85.26 
 
 
280 aa  437  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  84.86 
 
 
280 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  70.61 
 
 
251 aa  358  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  70.78 
 
 
251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  70.37 
 
 
251 aa  352  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  71.07 
 
 
247 aa  350  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  71.78 
 
 
249 aa  348  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 
255 aa  347  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  67.89 
 
 
254 aa  346  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  69.14 
 
 
252 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  68.15 
 
 
249 aa  345  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  68.55 
 
 
252 aa  344  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  69.2 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 
258 aa  341  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  68.6 
 
 
257 aa  339  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  65.75 
 
 
256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  69.42 
 
 
248 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  66.26 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  65.04 
 
 
250 aa  337  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  64.9 
 
 
253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  68.44 
 
 
261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  69.14 
 
 
252 aa  334  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
250 aa  333  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  67.49 
 
 
251 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  64.66 
 
 
249 aa  332  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 
261 aa  331  8e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  63.78 
 
 
254 aa  331  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  65.31 
 
 
248 aa  331  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  63.86 
 
 
250 aa  330  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  65.15 
 
 
252 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  68.72 
 
 
252 aa  328  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  65.43 
 
 
251 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  63.6 
 
 
254 aa  328  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  64.11 
 
 
250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 
247 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  65.43 
 
 
247 aa  325  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 
248 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 
248 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 
248 aa  324  7e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  64.2 
 
 
249 aa  324  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  65.16 
 
 
253 aa  324  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 
248 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 
248 aa  323  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  60.57 
 
 
250 aa  323  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  63.01 
 
 
252 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  68.72 
 
 
251 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  63.16 
 
 
248 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  63.16 
 
 
248 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 
248 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  62.35 
 
 
261 aa  322  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  64.32 
 
 
249 aa  321  8e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 
247 aa  321  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  66.4 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  62.75 
 
 
248 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  62.75 
 
 
248 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  59.76 
 
 
250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  62.3 
 
 
244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  63.79 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  62.3 
 
 
244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  61.98 
 
 
252 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  60.64 
 
 
250 aa  316  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  64.08 
 
 
257 aa  316  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 
248 aa  316  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 
248 aa  316  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  62.04 
 
 
246 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  61.26 
 
 
273 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 
248 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 
248 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 
248 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  61.54 
 
 
248 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  65.52 
 
 
243 aa  315  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 
248 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 
248 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  65.98 
 
 
268 aa  314  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  65.57 
 
 
268 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 
248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  65.16 
 
 
268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  62.2 
 
 
248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  63.82 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  63.64 
 
 
253 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  64.61 
 
 
251 aa  311  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  60.39 
 
 
262 aa  311  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0904  FeS assembly ATPase SufC  65.04 
 
 
272 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  60.8 
 
 
260 aa  309  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  60.08 
 
 
256 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  63.37 
 
 
262 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  60.32 
 
 
248 aa  308  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  60.82 
 
 
263 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  60.41 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  63.64 
 
 
253 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  62.96 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  60.32 
 
 
257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  62.14 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  63.49 
 
 
250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  62.04 
 
 
250 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  58.1 
 
 
256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>