More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0051 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  68.18 
 
 
244 aa  343  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  64.73 
 
 
246 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  64.32 
 
 
246 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  58.54 
 
 
257 aa  300  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  55.23 
 
 
248 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  51.63 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  48.81 
 
 
256 aa  244  9e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  49.41 
 
 
257 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  50.21 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  50.81 
 
 
248 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  47.77 
 
 
251 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  48.57 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  47.72 
 
 
258 aa  238  5e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  47.76 
 
 
247 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 
250 aa  236  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  47.98 
 
 
251 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  46.96 
 
 
253 aa  235  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
256 aa  234  7e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  49.15 
 
 
261 aa  234  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  50.41 
 
 
246 aa  234  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  46.77 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  49.18 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.56 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  48.58 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  48.16 
 
 
252 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  46.91 
 
 
250 aa  231  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  46.96 
 
 
251 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  47.37 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  47.92 
 
 
252 aa  230  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  48.63 
 
 
273 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  47.13 
 
 
257 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  45.12 
 
 
264 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  46.69 
 
 
256 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  48.77 
 
 
250 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
251 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  46.94 
 
 
251 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.69 
 
 
254 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  47.2 
 
 
280 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  48.99 
 
 
250 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  49.19 
 
 
254 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
256 aa  229  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  47.56 
 
 
249 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  45.9 
 
 
256 aa  229  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  46.37 
 
 
251 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  47.72 
 
 
257 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  46.5 
 
 
248 aa  228  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  46.4 
 
 
261 aa  228  7e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  47.54 
 
 
251 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  45.49 
 
 
249 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2432  FeS assembly ATPase SufC  45.36 
 
 
302 aa  227  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  46.72 
 
 
248 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  47.56 
 
 
249 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  48.37 
 
 
254 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  48.58 
 
 
250 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  46.61 
 
 
251 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  47.11 
 
 
253 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  47.74 
 
 
246 aa  226  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  48.58 
 
 
265 aa  226  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  46.56 
 
 
251 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  46.56 
 
 
252 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  47.3 
 
 
259 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.69 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  48.18 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  48.15 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  46.96 
 
 
252 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  50.82 
 
 
256 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.75 
 
 
251 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  48.15 
 
 
261 aa  225  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  46.72 
 
 
259 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  48.15 
 
 
261 aa  224  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
261 aa  224  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  48.15 
 
 
261 aa  224  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  48.15 
 
 
261 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  46.06 
 
 
265 aa  224  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  46.15 
 
 
253 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
250 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  46.15 
 
 
253 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  48.58 
 
 
252 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  46.94 
 
 
249 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  45.87 
 
 
256 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  44.81 
 
 
252 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  46.72 
 
 
259 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  46.53 
 
 
253 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  47.56 
 
 
253 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  45.71 
 
 
266 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.47 
 
 
253 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  47.54 
 
 
250 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  48.21 
 
 
255 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  48.15 
 
 
261 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  47.54 
 
 
250 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  45.93 
 
 
253 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  45.34 
 
 
267 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  46.34 
 
 
257 aa  222  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  46.59 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>