More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1658 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  76.61 
 
 
248 aa  391  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  48.77 
 
 
254 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  48.21 
 
 
252 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  48.8 
 
 
253 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  49.8 
 
 
252 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
259 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  48.37 
 
 
249 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  49.19 
 
 
259 aa  251  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  48.98 
 
 
257 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  48.8 
 
 
264 aa  251  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  51.63 
 
 
256 aa  251  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
261 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  49.18 
 
 
253 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  50.41 
 
 
256 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  49.18 
 
 
253 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
261 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
261 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
261 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  49.17 
 
 
250 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
261 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  47.62 
 
 
267 aa  248  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  46.61 
 
 
255 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
261 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  48.36 
 
 
253 aa  248  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  48.36 
 
 
257 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 
250 aa  247  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  47.6 
 
 
252 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  48.37 
 
 
253 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  48.57 
 
 
255 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  48.57 
 
 
259 aa  246  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  49.8 
 
 
251 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  46.94 
 
 
265 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  47.35 
 
 
262 aa  245  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.4 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  47.56 
 
 
259 aa  244  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  48.02 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  48.77 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  48.02 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  48.02 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  47.35 
 
 
258 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  48.58 
 
 
258 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  46.8 
 
 
260 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  47.76 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  47.52 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  46.59 
 
 
248 aa  241  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  47.77 
 
 
266 aa  240  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  47.15 
 
 
257 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  47.15 
 
 
252 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  47.15 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  46.53 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  46.94 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  46.96 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  48.13 
 
 
253 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
256 aa  238  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  47.79 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 
256 aa  238  9e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  45.68 
 
 
256 aa  236  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  45.02 
 
 
253 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  45.88 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  48.37 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  45.24 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  45.9 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  48.35 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  47.13 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  47.11 
 
 
261 aa  232  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  46.4 
 
 
252 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  46.18 
 
 
254 aa  232  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  48.15 
 
 
252 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  49.8 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  44.63 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  45.82 
 
 
265 aa  230  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1841  ABC transporter related  47.01 
 
 
251 aa  230  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  46.06 
 
 
252 aa  230  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  49.39 
 
 
246 aa  229  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  46.89 
 
 
249 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  45.12 
 
 
257 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  44.67 
 
 
251 aa  228  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  44.63 
 
 
247 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  44.22 
 
 
264 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  46.72 
 
 
247 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  48.79 
 
 
261 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  45.04 
 
 
249 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  47.3 
 
 
252 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  45.38 
 
 
261 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  43.78 
 
 
263 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  44.53 
 
 
252 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  44.26 
 
 
254 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  44.84 
 
 
255 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  47.11 
 
 
250 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  45.23 
 
 
248 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  43.03 
 
 
251 aa  225  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  46.5 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>