More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0260 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  65.7 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  61.16 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  63.37 
 
 		 245 aa  315  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  58.61 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  58.61 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  57.2 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  57.79 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  57.03 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  55.65 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  53.06 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  55.51 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  52.07 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  55.82 
 
 		 260 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  54.4 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  51.82 
 
 		 249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  54.22 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  53.31 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  54.55 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  51.25 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  52.8 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  50.83 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  52.4 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  50.42 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  51.25 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  51.2 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  45.02 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  42.52 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  40.89 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  38 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  38.34 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  37.8 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  38.96 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  40 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 250 aa  168  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  38.31 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  36.72 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  38.34 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  38.21 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  38.65 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  38.71 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  36.33 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  38 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  36.33 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  38.74 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  34.63 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  36.33 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  38.04 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  36.86 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  36.86 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  38.55 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  36.22 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  39.2 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  38.96 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  36.86 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.95 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  37.7 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  35.04 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  38.4 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.47 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  38.31 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  37.2 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  35.94 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  34.77 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  36.96 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  38.15 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  40.56 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  37.9 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  36.14 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  36.19 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  37.75 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  35.69 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  33.99 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  36.76 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  40.16 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  36.95 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  31.75 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  35.94 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  37.31 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  35.02 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  35.16 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  39.92 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  35.6 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  36.72 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>