More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2452 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  54.1 
 
 
245 aa  288  7e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  53.06 
 
 
254 aa  276  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 
247 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  51.57 
 
 
252 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  53.69 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  53.47 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  53.28 
 
 
251 aa  272  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  49.18 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
262 aa  267  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  51.59 
 
 
260 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  47.54 
 
 
248 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  47.54 
 
 
248 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  48.98 
 
 
242 aa  259  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  52.05 
 
 
246 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  47.95 
 
 
248 aa  258  7e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  49.18 
 
 
245 aa  257  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  47.13 
 
 
248 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  51.18 
 
 
254 aa  255  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
243 aa  254  7e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  50 
 
 
258 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  48.43 
 
 
253 aa  251  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  49.6 
 
 
262 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 
249 aa  249  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  48.43 
 
 
251 aa  248  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  47.86 
 
 
255 aa  244  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  45.7 
 
 
264 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  43.15 
 
 
250 aa  184  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  37.9 
 
 
243 aa  168  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 
256 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  37.01 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
248 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  38.78 
 
 
247 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  39.92 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  36.61 
 
 
256 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  37.6 
 
 
251 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  38.34 
 
 
257 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  35.97 
 
 
250 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  41.84 
 
 
246 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  41.84 
 
 
246 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  39.24 
 
 
265 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  38.19 
 
 
253 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  37.65 
 
 
251 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  37.35 
 
 
250 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
251 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  36 
 
 
252 aa  155  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  37.8 
 
 
250 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  37.2 
 
 
254 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  38.06 
 
 
257 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 
253 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
250 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 
253 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  38.06 
 
 
261 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.95 
 
 
270 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
261 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
261 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
261 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  37.65 
 
 
261 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
261 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  38.71 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  37.25 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
261 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  38.15 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  37.25 
 
 
251 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  36.95 
 
 
250 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  36.55 
 
 
250 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  36.95 
 
 
250 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  36.14 
 
 
248 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  35.34 
 
 
266 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  36.86 
 
 
262 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
261 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
252 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  37.05 
 
 
251 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  32.94 
 
 
248 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
250 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  34.65 
 
 
246 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  35.88 
 
 
254 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  35.04 
 
 
256 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
250 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.38 
 
 
261 aa  148  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.14 
 
 
249 aa  148  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  38.74 
 
 
259 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  35.69 
 
 
261 aa  148  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  34.94 
 
 
248 aa  148  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  34.96 
 
 
248 aa  148  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  34.23 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.47 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  36.17 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  34.54 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  35.97 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  36 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  36.14 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  35.34 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  34.94 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  35.43 
 
 
262 aa  146  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>