More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2223 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  61.98 
 
 
242 aa  325  6e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  63.67 
 
 
245 aa  324  9e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  65.7 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  55.37 
 
 
246 aa  277  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  54.13 
 
 
248 aa  271  7e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  53.69 
 
 
251 aa  270  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  54.4 
 
 
252 aa  270  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  55.6 
 
 
253 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  53.31 
 
 
248 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  53.31 
 
 
248 aa  269  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  54.13 
 
 
248 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  53.69 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  53.69 
 
 
251 aa  268  5e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  54.8 
 
 
254 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  54.03 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  54.62 
 
 
258 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  54.22 
 
 
264 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  52.4 
 
 
251 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  54.92 
 
 
246 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  54.03 
 
 
262 aa  262  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  53.54 
 
 
255 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  49.8 
 
 
246 aa  254  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  50.99 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
249 aa  245  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  51.25 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  45.16 
 
 
246 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  39.59 
 
 
248 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  44.76 
 
 
246 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  42.62 
 
 
248 aa  169  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  37.08 
 
 
243 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  39.53 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  40.16 
 
 
250 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  37.96 
 
 
250 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  38.8 
 
 
261 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  38.21 
 
 
250 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  40.26 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  38.43 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 
244 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  37.21 
 
 
250 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
243 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  38.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  38.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  39.76 
 
 
257 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  38.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  36.55 
 
 
251 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  38.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  38.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  36.8 
 
 
248 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  37.75 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  37.6 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  36.8 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.8 
 
 
249 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  36.61 
 
 
253 aa  152  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  37.01 
 
 
264 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.68 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  36.69 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  37.6 
 
 
248 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  37.6 
 
 
248 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
257 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  37.6 
 
 
248 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  37.6 
 
 
248 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  37.6 
 
 
248 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  37.6 
 
 
248 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  37.6 
 
 
248 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  36.92 
 
 
252 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  39.92 
 
 
252 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  35.2 
 
 
254 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  36.51 
 
 
251 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  39.84 
 
 
252 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 
256 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  35.43 
 
 
248 aa  148  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  35.83 
 
 
248 aa  148  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  37.2 
 
 
259 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  36.08 
 
 
267 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  38.46 
 
 
261 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  35.2 
 
 
250 aa  148  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
261 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 
261 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  37.2 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.61 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  38.46 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  37.2 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  35.91 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  36.22 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00801  ABC transporter, ATP binding component  35.27 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.681309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  38.46 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  35.04 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  38.46 
 
 
261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  35.6 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  35.37 
 
 
256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
261 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
261 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  36.95 
 
 
249 aa  146  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  38 
 
 
257 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>