More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1200 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  67.72 
 
 		 255 aa  358  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  65.08 
 
 		 252 aa  350  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  67.86 
 
 		 260 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  66.53 
 
 		 262 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  63.75 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  62.85 
 
 		 264 aa  329  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  59.6 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  52.17 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  55.6 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  51.79 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  50 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  52.4 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  51.79 
 
 		 245 aa  258  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  48.81 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  49.2 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  49.8 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  47.04 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  48.43 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  47.04 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  46.64 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  47.43 
 
 		 246 aa  248  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  38.91 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  39.23 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  38.85 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  39.92 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  32.26 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  37.36 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  35.34 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  34.02 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  37.7 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  35.29 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  37.3 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  37.7 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  35.14 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  35.23 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  35.91 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  31.58 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  35.09 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  36.43 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  35.52 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  36.61 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  37.3 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  35.14 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.09 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  37.3 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  36.89 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  35.16 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  38.52 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  38.52 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  38.52 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  35.41 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  34.72 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  35.09 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  36.12 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  35.5 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  36.48 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  36.48 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  36.48 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  35.91 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  33.98 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  36.26 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  36.48 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  34.72 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  36.48 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  36.48 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  34.23 
 
 		 261 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  35.11 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  36.19 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  35.41 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  33.21 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.46 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  35.14 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  35.25 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  35.41 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  35.41 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  37.3 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  36.78 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  35.14 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  35.25 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  35.83 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  35.52 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  35.47 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  36.07 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  36.07 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  33.84 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  36.9 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>