More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1078 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  67.76 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  51.81 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  52.05 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  54.47 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  54.07 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  53.25 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  52.99 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  51 
 
 		 251 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  52.99 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  51.43 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 262 aa  258  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  51.43 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  48.4 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  50.41 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  52.05 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  50.61 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  49.38 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  49.41 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  49.4 
 
 		 258 aa  244  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  49.59 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  49 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  49.21 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  48.59 
 
 		 262 aa  238  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  49.39 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  38.43 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  39.2 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  37.19 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 		 250 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  37.89 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  35.08 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  37.3 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  36.36 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  35.08 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  34.78 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  36.22 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  36.22 
 
 		 261 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 		 261 aa  148  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  36.22 
 
 		 261 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.1 
 
 		 253 aa  148  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  35.18 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  35.71 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  33.86 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  33.86 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  33.98 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  35.83 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  35.43 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  33.72 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1841  ABC transporter related  34.11 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  35.2 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  37.3 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.88 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  33.73 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  33.59 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  35.14 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.26 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  36.9 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.26 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0402  FeS assembly ATPase SufC  32.02 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000798388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  33.73 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2270  FeS assembly ATPase SufC  34.26 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  30.62 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  34.36 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  35.16 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  32.28 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  31.82 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  33.72 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  34.65 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  33.46 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  30.8 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  34 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  34.1 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  34.8 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  33.46 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  33.46 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  32.68 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  32.52 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  33.21 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  32.95 
 
 		 252 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  33.07 
 
 		 247 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  32.69 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  33.2 
 
 		 261 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  31.15 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.56 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  32.56 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  33.86 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  32.81 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  32.68 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  33.98 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  32.8 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>