More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1000 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  516  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  75.79 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  72.16 
 
 		 255 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  74.21 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  72.22 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  70.52 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  65.08 
 
 		 253 aa  350  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  62 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  54.58 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  57.2 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  53.36 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  54 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  53.97 
 
 		 251 aa  275  5e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  51.57 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  53.17 
 
 		 251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  50.2 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  52.78 
 
 		 251 aa  271  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  49.2 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  49.4 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  50.2 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  47.2 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  46.4 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  46.4 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  48 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  39.02 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  34.41 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  39.62 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  36.33 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  39.25 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  38.59 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  34.82 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  38.04 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  34.27 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  37.21 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  35.98 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  36.29 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  34.51 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  35.8 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  34.22 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  37.21 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.15 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  35.52 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  36.36 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  33.59 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.96 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  33.72 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  35.41 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  34.02 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  35.86 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  35.41 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  36.33 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  38.49 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  33.78 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  33.71 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  35.88 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  35.38 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  35.38 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  35.56 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  32.69 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  34.84 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  32.45 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  35.92 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  30.97 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  35.66 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  33.72 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  34.84 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  35.98 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  36.4 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  32.7 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  36.55 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  36.82 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  36.82 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  35.98 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  36.82 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  36.82 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  36.6 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  36.82 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  34.31 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  36.82 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  35.98 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  35.98 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  35.54 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  36.82 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  36.82 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  33.74 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  34.02 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  33.74 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  35.83 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>