More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3458 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  53.95 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  53.51 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  49.56 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  48.9 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  51.11 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  48.87 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  51.64 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  45.13 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  37.89 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  40.47 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  40.09 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  35.91 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  43.46 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  39.17 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  40.55 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  39.08 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  39.45 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  39.06 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  40.99 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  40.99 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  37.44 
 
 		 264 aa  144  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  37.56 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  39.91 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  39.27 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  38.6 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  40.54 
 
 		 261 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  37.07 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  37.74 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  40.54 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  38.74 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  40.54 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  40 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  40 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  38.18 
 
 		 253 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  36.41 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  36.49 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  40.54 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  37.16 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  36.94 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  35.16 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  36.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  39.27 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  39.35 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  36.1 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  38.16 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  37.56 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  36.1 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  34.57 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  37.33 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  37.79 
 
 		 249 aa  138  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  36.1 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  38.18 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.04 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  38.14 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  35.74 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  38.14 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  38.14 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  38.14 
 
 		 248 aa  136  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  35.94 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  35.59 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  38.14 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  35.19 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  36.07 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  35.59 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  37.78 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  38.03 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  36.07 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  35.98 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  38.07 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  36.4 
 
 		 253 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  41.71 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  36.07 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  36.55 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  36.82 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  37.33 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  37.39 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  37.39 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  37.21 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  36.24 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  36.74 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  34.56 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  38.03 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  36.74 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  33.78 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  33.78 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  37.73 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>