More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1371 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  61.2 
 
 		 262 aa  324  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  59.76 
 
 		 254 aa  318  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  54.58 
 
 		 252 aa  289  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  56.35 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  55.56 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  55.95 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  56.35 
 
 		 260 aa  285  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  55.56 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  56.57 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  55.38 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  53.54 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  52.17 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  52.4 
 
 		 242 aa  264  8.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  52.4 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  50.4 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  49.6 
 
 		 246 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  50.99 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  49.21 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  49.6 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  50.4 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  49.2 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  49.6 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  48.43 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  51.2 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 		 249 aa  244  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  39.22 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  40.16 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  37.31 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  35.77 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  39 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  36.15 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  35.77 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  36.15 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  38.43 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  38.08 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  38.08 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  38.08 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  35.63 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  38.08 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  38.08 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  35.77 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  38.04 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  35.63 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  35.63 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  34.55 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  35.94 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  35.94 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  35.02 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  37.31 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  36.86 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  35.74 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  33.46 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  38.61 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  35.55 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  35.55 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  35.55 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  35.94 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  35.55 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  36.54 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  37.5 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  36.54 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  35.02 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  36.54 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  36.54 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  36.54 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  35.55 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  36.54 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  36.54 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  39.39 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  36.54 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  36.54 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  35.16 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  38 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  35.38 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  35.41 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  35.38 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  39.02 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  36.59 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  36.96 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  36.36 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  36.47 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  36.86 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  35 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  36.92 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.14 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  35.14 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.47 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  39.06 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  35.14 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  35.91 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  34.75 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>