More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1310 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  99.59 
 
 
243 aa  487  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  58.26 
 
 
243 aa  295  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  54.43 
 
 
247 aa  285  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  53.31 
 
 
241 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  53.51 
 
 
236 aa  248  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
252 aa  226  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  45.98 
 
 
234 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  45.67 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  42.61 
 
 
258 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  38.72 
 
 
240 aa  168  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  38.72 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 
248 aa  154  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
247 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 
256 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  38.77 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  37.33 
 
 
248 aa  146  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  38.05 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  33.06 
 
 
254 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  37.04 
 
 
243 aa  141  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.2 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  37.12 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  40.18 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  36.77 
 
 
228 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  35.34 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  37 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  37.34 
 
 
249 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  34.91 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  32.46 
 
 
253 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  32.89 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  32.46 
 
 
253 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  31.97 
 
 
246 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
261 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
261 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
261 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  34.82 
 
 
245 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  34.93 
 
 
260 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  32.89 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  32.89 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  34.91 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  32.46 
 
 
253 aa  135  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  33.62 
 
 
262 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 
243 aa  135  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  32.46 
 
 
261 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  32.46 
 
 
261 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  34.5 
 
 
253 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  36.82 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  35.35 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  31.97 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  36.82 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  34.48 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  32.46 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0074  FeS assembly ATPase SufC  35.81 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  34.93 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  35.56 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  35.06 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  36.09 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00801  ABC transporter, ATP binding component  33.33 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.681309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  34.51 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  33.19 
 
 
252 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  30.74 
 
 
251 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  34.31 
 
 
256 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  33.9 
 
 
264 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  33.61 
 
 
252 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  34.94 
 
 
252 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  33.74 
 
 
263 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  34.51 
 
 
257 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  34.36 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  33.74 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  32.92 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  32.31 
 
 
262 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  34.05 
 
 
259 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 
256 aa  132  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  35.65 
 
 
246 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  33.05 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  37.22 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  29.92 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  34.22 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  32.79 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  33.64 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  31.43 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  35.53 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  33.05 
 
 
250 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 
250 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 
256 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  31.82 
 
 
261 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  33.87 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  34.2 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  32.3 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  34.82 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>